Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Gm25014-201ENSMUST00000158401 103 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Olfr880-ps1-201ENSMUST00000212344 229 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Gm24455-201ENSMUST00000083348 131 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Gm23314-201ENSMUST00000157218 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Lmx1aQ9JKU8 Gm23601-201ENSMUST00000157259 131 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Lmx1aQ9JKU8 Gm22542-201ENSMUST00000158166 95 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Lmx1aQ9JKU8 Gm26712-201ENSMUST00000180813 217 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Lmx1aQ9JKU8 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Lmx1aQ9JKU8 Gm26011-201ENSMUST00000104410 104 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Lmx1aQ9JKU8 Gm25680-201ENSMUST00000116917 126 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Lmx1aQ9JKU8 Gm22635-201ENSMUST00000116962 126 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Lmx1aQ9JKU8 Gm25055-201ENSMUST00000157369 76 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Lmx1aQ9JKU8 Gm24686-201ENSMUST00000157755 93 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Lmx1aQ9JKU8 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Lmx1aQ9JKU8 Gm25367-201ENSMUST00000158846 106 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Lmx1aQ9JKU8 Gm24823-201ENSMUST00000175092 91 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Lmx1aQ9JKU8 Mir145a-201ENSMUST00000083658 70 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Lmx1aQ9JKU8 Gm25091-201ENSMUST00000103997 71 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Lmx1aQ9JKU8 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Lmx1aQ9JKU8 Gm24913-201ENSMUST00000157286 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Lmx1aQ9JKU8 Gm25656-201ENSMUST00000158466 66 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Lmx1aQ9JKU8 Gm26062-201ENSMUST00000083379 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Lmx1aQ9JKU8 Gm24649-201ENSMUST00000157106 134 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Lmx1aQ9JKU8 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Lmx1aQ9JKU8 Snora16a-201ENSMUST00000083163 136 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Lmx1aQ9JKU8 Gm26168-201ENSMUST00000083787 112 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Lmx1aQ9JKU8 Mir802-201ENSMUST00000103258 97 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Lmx1aQ9JKU8 Gm26084-201ENSMUST00000157903 104 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Lmx1aQ9JKU8 Gm25618-201ENSMUST00000179484 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Lmx1aQ9JKU8 Gm24508-201ENSMUST00000180104 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Lmx1aQ9JKU8 AC158982.2-201ENSMUST00000226283 184 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Lmx1aQ9JKU8 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Lmx1aQ9JKU8 Gm26369-201ENSMUST00000157825 100 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Lmx1aQ9JKU8 Gm25993-201ENSMUST00000175391 80 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Lmx1aQ9JKU8 Gm27694-201ENSMUST00000184740 86 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Lmx1aQ9JKU8 Gm26438-201ENSMUST00000082593 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Lmx1aQ9JKU8 Gm23056-201ENSMUST00000082803 111 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Lmx1aQ9JKU8 Mir669b-201ENSMUST00000102172 97 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm23715-201ENSMUST00000157354 106 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Mir378c-201ENSMUST00000184478 99 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Mir183-201ENSMUST00000083685 70 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm25337-201ENSMUST00000083723 104 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm26081-201ENSMUST00000104068 132 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm23351-201ENSMUST00000158427 125 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Mir344h-1-201ENSMUST00000174922 60 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Mir344h-2-201ENSMUST00000175612 60 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm27699-201ENSMUST00000183553 180 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm24457-201ENSMUST00000083196 105 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm22772-201ENSMUST00000104451 121 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm24983-201ENSMUST00000104457 69 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm22203-201ENSMUST00000158605 58 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 AC126939.1-201ENSMUST00000224943 226 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm23344-201ENSMUST00000083818 68 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm23986-201ENSMUST00000157144 63 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm25522-201ENSMUST00000158394 105 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm25249-201ENSMUST00000175471 78 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm8034-201ENSMUST00000178853 132 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 mt-Tw-201ENSMUST00000082397 67 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm22212-201ENSMUST00000158096 106 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Snora26-201ENSMUST00000175614 121 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm37746-201ENSMUST00000193249 198 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm22455-201ENSMUST00000082580 71 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Snord47-201ENSMUST00000083034 77 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm24141-201ENSMUST00000122776 115 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm24717-201ENSMUST00000157522 124 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm26498-201ENSMUST00000177799 79 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm26230-201ENSMUST00000180141 79 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Mir509-201ENSMUST00000196089 75 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm24202-201ENSMUST00000082948 103 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Mir148a-201ENSMUST00000083571 99 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm22827-201ENSMUST00000083766 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Lmx1aQ9JKU8 Mir574-201ENSMUST00000103854 78 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Lmx1aQ9JKU8 Gm25510-201ENSMUST00000116986 123 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Lmx1aQ9JKU8 Gm25388-201ENSMUST00000157339 151 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Lmx1aQ9JKU8 Gm24296-201ENSMUST00000158297 106 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Lmx1aQ9JKU8 Gm39149-201ENSMUST00000210258 186 ntTSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
Lmx1aQ9JKU8 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Lmx1aQ9JKU8 Gm25635-201ENSMUST00000082675 131 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Lmx1aQ9JKU8 Snord80-201ENSMUST00000083801 81 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Lmx1aQ9JKU8 Gm26359-201ENSMUST00000158873 101 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Lmx1aQ9JKU8 Gm22708-201ENSMUST00000158987 103 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Lmx1aQ9JKU8 Gm23864-201ENSMUST00000177607 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Lmx1aQ9JKU8 Gm45492-201ENSMUST00000211611 288 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Lmx1aQ9JKU8 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Lmx1aQ9JKU8 Mir669h-201ENSMUST00000116944 125 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Lmx1aQ9JKU8 Gm14533-201ENSMUST00000117088 93 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Lmx1aQ9JKU8 Gm24868-201ENSMUST00000157265 136 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Lmx1aQ9JKU8 Gm24077-201ENSMUST00000158183 136 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
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