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Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0
Rcan3, Calcipressin-3, mouse
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239 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Rcan3
Q9JKK0
7330423F06Rik-201
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BASIC
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□□□□□ -2.42
Rcan3
Q9JKK0
Mir3065-201
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87 nt
BASIC
-0.05
□□□□□ -2.42
Rcan3
Q9JKK0
Gm43324-201
ENSMUST00000197482
289 nt
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
Rcan3
Q9JKK0
Gm44328-201
ENSMUST00000199331
75 nt
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
Rcan3
Q9JKK0
Gm45429-201
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172 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Rcan3
Q9JKK0
Gm45617-201
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209 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Rcan3
Q9JKK0
Gm25635-201
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BASIC
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□□□□□ -2.42
Rcan3
Q9JKK0
Snord85-201
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BASIC
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□□□□□ -2.42
Rcan3
Q9JKK0
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BASIC
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□□□□□ -2.42
Rcan3
Q9JKK0
Gm27980-201
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BASIC
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□□□□□ -2.42
Rcan3
Q9JKK0
Gm38208-201
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BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Rcan3
Q9JKK0
n-R5s12-201
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□□□□□ -2.42
Rcan3
Q9JKK0
Snord78-201
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BASIC
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□□□□□ -2.42
Rcan3
Q9JKK0
Gm25309-201
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BASIC
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□□□□□ -2.43
Rcan3
Q9JKK0
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144 nt
BASIC
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□□□□□ -2.43
Rcan3
Q9JKK0
Mir196a-2-201
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85 nt
BASIC
-0.1
□□□□□ -2.43
Rcan3
Q9JKK0
2210418O10Rik-202
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TSL 5
BASIC
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□□□□□ -2.43
Rcan3
Q9JKK0
Gm22336-201
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BASIC
-0.11
□□□□□ -2.43
Rcan3
Q9JKK0
Gm26712-201
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217 nt
BASIC
-0.11
□□□□□ -2.43
Rcan3
Q9JKK0
Mir3967-201
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68 nt
BASIC
-0.11
□□□□□ -2.43
Rcan3
Q9JKK0
Gm25791-201
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137 nt
BASIC
-0.11
□□□□□ -2.43
Rcan3
Q9JKK0
Gm24796-201
ENSMUST00000104007
107 nt
BASIC
-0.12
□□□□□ -2.43
Rcan3
Q9JKK0
Gm12086-201
ENSMUST00000120863
228 nt
BASIC
-0.12
□□□□□ -2.43
Rcan3
Q9JKK0
Gm25370-201
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BASIC
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□□□□□ -2.43
Rcan3
Q9JKK0
Gm26007-201
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BASIC
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□□□□□ -2.43
Rcan3
Q9JKK0
Gm2077-201
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319 nt
BASIC
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□□□□□ -2.43
Rcan3
Q9JKK0
Gm45374-201
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136 nt
BASIC
-0.12
□□□□□ -2.43
Rcan3
Q9JKK0
Gm22149-201
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136 nt
BASIC
-0.13
□□□□□ -2.43
Rcan3
Q9JKK0
Gm22319-201
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122 nt
BASIC
-0.13
□□□□□ -2.43
Rcan3
Q9JKK0
Gm22384-201
ENSMUST00000158187
104 nt
BASIC
-0.13
□□□□□ -2.43
Rcan3
Q9JKK0
Gm22297-201
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106 nt
BASIC
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□□□□□ -2.43
Rcan3
Q9JKK0
Gm23060-201
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109 nt
BASIC
-0.14
□□□□□ -2.43
Rcan3
Q9JKK0
Gm22077-201
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93 nt
BASIC
-0.14
□□□□□ -2.43
Rcan3
Q9JKK0
Gm24947-201
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110 nt
BASIC
-0.14
□□□□□ -2.43
Rcan3
Q9JKK0
Gm25978-201
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90 nt
BASIC
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□□□□□ -2.43
Rcan3
Q9JKK0
Mir6905-201
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BASIC
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□□□□□ -2.43
Rcan3
Q9JKK0
Mir29a-201
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BASIC
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□□□□□ -2.43
Rcan3
Q9JKK0
Gm10813-201
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90 nt
BASIC
-0.15
□□□□□ -2.43
Rcan3
Q9JKK0
Mir363-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
Rcan3
Q9JKK0
Gm22327-201
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BASIC
-0.17
□□□□□ -2.44
Rcan3
Q9JKK0
Rnu6-ps2-201
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BASIC
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Rcan3
Q9JKK0
Gm22286-201
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BASIC
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Rcan3
Q9JKK0
Traj9-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
Rcan3
Q9JKK0
Mir297a-2-201
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BASIC
-0.18
□□□□□ -2.44
Rcan3
Q9JKK0
Gm23783-201
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102 nt
BASIC
-0.18
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Rcan3
Q9JKK0
Gm24772-201
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110 nt
BASIC
-0.18
□□□□□ -2.44
Rcan3
Q9JKK0
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BASIC
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□□□□□ -2.44
Rcan3
Q9JKK0
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189 nt
BASIC
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Rcan3
Q9JKK0
Mir382-201
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BASIC
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Rcan3
Q9JKK0
Mir200b-201
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BASIC
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Rcan3
Q9JKK0
Gm24903-201
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126 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
Rcan3
Q9JKK0
Mir509-201
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BASIC
-0.19
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Rcan3
Q9JKK0
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BASIC
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□□□□□ -2.44
Rcan3
Q9JKK0
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BASIC
-0.2
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Rcan3
Q9JKK0
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BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
Rcan3
Q9JKK0
Rab11fip4os2-202
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355 nt
TSL 1 (best)
BASIC
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□□□□□ -2.44
Rcan3
Q9JKK0
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BASIC
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Rcan3
Q9JKK0
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BASIC
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□□□□□ -2.44
Rcan3
Q9JKK0
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BASIC
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Rcan3
Q9JKK0
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BASIC
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Rcan3
Q9JKK0
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BASIC
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□□□□□ -2.44
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BASIC
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Rcan3
Q9JKK0
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156 nt
APPRIS ALT2
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
Rcan3
Q9JKK0
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BASIC
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□□□□□ -2.44
Rcan3
Q9JKK0
Gm11250-201
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TSL 5
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
Rcan3
Q9JKK0
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BASIC
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Rcan3
Q9JKK0
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BASIC
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□□□□□ -2.44
Rcan3
Q9JKK0
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BASIC
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□□□□□ -2.44
Rcan3
Q9JKK0
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BASIC
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□□□□□ -2.44
Rcan3
Q9JKK0
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BASIC
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□□□□□ -2.44
Rcan3
Q9JKK0
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BASIC
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□□□□□ -2.44
Rcan3
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BASIC
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□□□□□ -2.45
Rcan3
Q9JKK0
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BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
Rcan3
Q9JKK0
Mir7079-201
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Rcan3
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Rcan3
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BASIC
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□□□□□ -2.45
Rcan3
Q9JKK0
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BASIC
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□□□□□ -2.45
Rcan3
Q9JKK0
Gm22088-201
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BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
Rcan3
Q9JKK0
n-R5s42-201
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BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
Rcan3
Q9JKK0
Gm43885-201
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2542 nt
BASIC
-0.25
□□□□□ -2.45
Rcan3
Q9JKK0
Gm23434-201
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100 nt
BASIC
-0.25
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Rcan3
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mt-Tn-201
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BASIC
-0.25
□□□□□ -2.45
Rcan3
Q9JKK0
Gm25337-201
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104 nt
BASIC
-0.25
□□□□□ -2.45
Rcan3
Q9JKK0
Gm22203-201
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BASIC
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□□□□□ -2.45
Rcan3
Q9JKK0
Gm25993-201
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BASIC
-0.26
□□□□□ -2.45
Rcan3
Q9JKK0
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BASIC
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□□□□□ -2.45
Rcan3
Q9JKK0
Gm20734-201
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193 nt
BASIC
-0.26
□□□□□ -2.45
Rcan3
Q9JKK0
Mir126a-201
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73 nt
BASIC
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□□□□□ -2.45
Rcan3
Q9JKK0
Gm25889-201
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107 nt
BASIC
-0.27
□□□□□ -2.45
Rcan3
Q9JKK0
Gm25307-201
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106 nt
BASIC
-0.27
□□□□□ -2.45
Rcan3
Q9JKK0
Gm25160-201
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102 nt
BASIC
-0.27
□□□□□ -2.45
Rcan3
Q9JKK0
Gm29432-201
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139 nt
BASIC
-0.27
□□□□□ -2.45
Rcan3
Q9JKK0
Gm25915-201
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126 nt
BASIC
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□□□□□ -2.45
Rcan3
Q9JKK0
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68 nt
BASIC
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□□□□□ -2.45
Rcan3
Q9JKK0
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93 nt
BASIC
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□□□□□ -2.45
Rcan3
Q9JKK0
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184 nt
BASIC
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□□□□□ -2.46
Rcan3
Q9JKK0
Gm24256-201
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84 nt
BASIC
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□□□□□ -2.46
Rcan3
Q9JKK0
Mir669h-201
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125 nt
BASIC
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□□□□□ -2.46
Rcan3
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Ranbp2-ps1-201
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□□□□□ -2.46
Rcan3
Q9JKK0
Gm24894-201
ENSMUST00000122744
118 nt
BASIC
-0.31
□□□□□ -2.46
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