Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Chmp3Q9CQ10 Gm22067-201ENSMUST00000122790 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Chmp3Q9CQ10 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Chmp3Q9CQ10 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Chmp3Q9CQ10 AC154506.4-201ENSMUST00000224898 3416 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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Chmp3Q9CQ10 Gm24988-201ENSMUST00000104460 121 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Chmp3Q9CQ10 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Chmp3Q9CQ10 Gm22540-201ENSMUST00000158168 117 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Chmp3Q9CQ10 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Chmp3Q9CQ10 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.13
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Chmp3Q9CQ10 Gm23291-201ENSMUST00000175611 78 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Chmp3Q9CQ10 Gm43038-201ENSMUST00000202359 88 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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Chmp3Q9CQ10 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Chmp3Q9CQ10 Gm22539-201ENSMUST00000158167 117 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Chmp3Q9CQ10 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Chmp3Q9CQ10 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
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Chmp3Q9CQ10 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Chmp3Q9CQ10 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Chmp3Q9CQ10 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Chmp3Q9CQ10 Gm22541-201ENSMUST00000158165 127 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Chmp3Q9CQ10 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
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Chmp3Q9CQ10 Gm25622-201ENSMUST00000157217 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Chmp3Q9CQ10 Gm24073-201ENSMUST00000158177 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Chmp3Q9CQ10 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Chmp3Q9CQ10 Gm43907-201ENSMUST00000203128 117 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Chmp3Q9CQ10 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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Chmp3Q9CQ10 AC147560.1-201ENSMUST00000197528 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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Chmp3Q9CQ10 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Chmp3Q9CQ10 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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Chmp3Q9CQ10 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Chmp3Q9CQ10 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Chmp3Q9CQ10 Gm6272-201ENSMUST00000121256 171 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Chmp3Q9CQ10 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Chmp3Q9CQ10 Snora75-201ENSMUST00000082903 133 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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Chmp3Q9CQ10 Gm23570-201ENSMUST00000083029 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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Chmp3Q9CQ10 AC158537.2-201ENSMUST00000223575 150 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Chmp3Q9CQ10 Gm23376-201ENSMUST00000082938 160 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Chmp3Q9CQ10 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
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Chmp3Q9CQ10 Gm26029-201ENSMUST00000158659 132 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Chmp3Q9CQ10 Gm22406-201ENSMUST00000174923 93 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Chmp3Q9CQ10 Mir6962-201ENSMUST00000199512 63 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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Chmp3Q9CQ10 Gm25991-201ENSMUST00000102439 99 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Chmp3Q9CQ10 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Chmp3Q9CQ10 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Chmp3Q9CQ10 Gm25619-201ENSMUST00000122621 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Chmp3Q9CQ10 Gm26359-201ENSMUST00000158873 101 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Chmp3Q9CQ10 Snord2-201ENSMUST00000157899 69 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Chmp3Q9CQ10 Gm23306-201ENSMUST00000179058 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Chmp3Q9CQ10 Mir376b-201ENSMUST00000195930 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Chmp3Q9CQ10 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Chmp3Q9CQ10 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Chmp3Q9CQ10 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Chmp3Q9CQ10 Gm22100-201ENSMUST00000157926 63 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Chmp3Q9CQ10 Gm5581-201ENSMUST00000072940 2550 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Chmp3Q9CQ10 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
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