Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm24983-201ENSMUST00000104457 69 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm24378-201ENSMUST00000122699 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm26029-201ENSMUST00000158659 132 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ubash3bQ8BGG7 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ubash3bQ8BGG7 Traj34-201ENSMUST00000103707 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Ubash3bQ8BGG7 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm23477-201ENSMUST00000158882 128 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ubash3bQ8BGG7 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Ubash3bQ8BGG7 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm11111-201ENSMUST00000112956 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm22100-201ENSMUST00000157926 63 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ubash3bQ8BGG7 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ubash3bQ8BGG7 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ubash3bQ8BGG7 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Mir3064-201ENSMUST00000175532 67 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 AC147560.1-201ENSMUST00000197528 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Mir126a-201ENSMUST00000083606 73 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm23991-201ENSMUST00000117033 93 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm22406-201ENSMUST00000174923 93 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm21836-201ENSMUST00000178787 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm23500-201ENSMUST00000157735 98 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm24134-201ENSMUST00000083361 71 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm25040-201ENSMUST00000103877 66 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm22203-201ENSMUST00000158605 58 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm38323-201ENSMUST00000192450 210 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ubash3bQ8BGG7 Snord2-201ENSMUST00000157899 69 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm24073-201ENSMUST00000158177 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm24638-201ENSMUST00000179807 132 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ubash3bQ8BGG7 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm22761-201ENSMUST00000102278 96 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Ubash3bQ8BGG7 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Ubash3bQ8BGG7 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ubash3bQ8BGG7 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ubash3bQ8BGG7 Mir376b-201ENSMUST00000195930 82 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ubash3bQ8BGG7 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ubash3bQ8BGG7 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ubash3bQ8BGG7 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ubash3bQ8BGG7 Mir741-201ENSMUST00000103931 71 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm25759-201ENSMUST00000103988 129 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm24396-201ENSMUST00000116905 93 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm27549-201ENSMUST00000183508 62 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm24580-201ENSMUST00000103965 131 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ubash3bQ8BGG7 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ubash3bQ8BGG7 Gm6272-201ENSMUST00000121256 171 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ubash3bQ8BGG7 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ubash3bQ8BGG7 Svbp-204ENSMUST00000210595 150 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 190.4 ms