Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
Ccdc18Q640L5 Gm25158-201ENSMUST00000177681 121 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
Ccdc18Q640L5 Gm26229-201ENSMUST00000179699 121 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
Ccdc18Q640L5 AC145736.2-201ENSMUST00000216305 365 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
Ccdc18Q640L5 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
Ccdc18Q640L5 Gm23173-201ENSMUST00000157161 160 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
Ccdc18Q640L5 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
Ccdc18Q640L5 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
Ccdc18Q640L5 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
Ccdc18Q640L5 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC-4.36□□□□□ -3.11
Ccdc18Q640L5 Mir509-201ENSMUST00000196089 75 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
Ccdc18Q640L5 Gm23448-201ENSMUST00000083151 104 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
Ccdc18Q640L5 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-4.36□□□□□ -3.11
Ccdc18Q640L5 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
Ccdc18Q640L5 Gm26231-201ENSMUST00000175218 67 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
Ccdc18Q640L5 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC-4.37□□□□□ -3.11
Ccdc18Q640L5 Gm25229-201ENSMUST00000178587 79 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
Ccdc18Q640L5 Mir29a-201ENSMUST00000083676 88 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
Ccdc18Q640L5 Gm25862-201ENSMUST00000158250 129 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
Ccdc18Q640L5 Mir367-201ENSMUST00000083479 75 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
Ccdc18Q640L5 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
Ccdc18Q640L5 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
Ccdc18Q640L5 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
Ccdc18Q640L5 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
Ccdc18Q640L5 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
Ccdc18Q640L5 Mirlet7a-1-201ENSMUST00000083487 94 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
Ccdc18Q640L5 Mir21c-201ENSMUST00000184910 78 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
Ccdc18Q640L5 Gm21940-201ENSMUST00000204940 2278 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
Ccdc18Q640L5 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
Ccdc18Q640L5 Gm25440-201ENSMUST00000158279 154 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
Ccdc18Q640L5 Gm23817-201ENSMUST00000158449 104 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
Ccdc18Q640L5 Gm23303-201ENSMUST00000082714 152 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
Ccdc18Q640L5 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
Ccdc18Q640L5 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
Ccdc18Q640L5 Mir7673-201ENSMUST00000184567 64 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
Ccdc18Q640L5 Gm9805-201ENSMUST00000055305 171 ntAPPRIS P1 BASIC-4.43□□□□□ -3.12
Ccdc18Q640L5 Gm25705-201ENSMUST00000083119 104 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
Ccdc18Q640L5 Gm22055-201ENSMUST00000083388 107 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
Ccdc18Q640L5 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
Ccdc18Q640L5 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
Ccdc18Q640L5 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
Ccdc18Q640L5 Traj53-201ENSMUST00000103690 66 ntAPPRIS P1 BASIC-4.45□□□□□ -3.12
Ccdc18Q640L5 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-4.45□□□□□ -3.12
Ccdc18Q640L5 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
Ccdc18Q640L5 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-4.46□□□□□ -3.12
Ccdc18Q640L5 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
Ccdc18Q640L5 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.12
Ccdc18Q640L5 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.12
Ccdc18Q640L5 Mir190b-201ENSMUST00000104803 80 ntBASIC-4.48□□□□□ -3.13
Ccdc18Q640L5 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
Ccdc18Q640L5 Gm26307-201ENSMUST00000157767 126 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
Ccdc18Q640L5 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
Ccdc18Q640L5 Gm44409-201ENSMUST00000198810 166 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
Ccdc18Q640L5 Mir539-201ENSMUST00000102109 74 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
Ccdc18Q640L5 Gm23730-201ENSMUST00000083236 107 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
Ccdc18Q640L5 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
Ccdc18Q640L5 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
Ccdc18Q640L5 Gm22336-201ENSMUST00000157719 107 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
Ccdc18Q640L5 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
Ccdc18Q640L5 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
Ccdc18Q640L5 Gm25618-201ENSMUST00000179484 107 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
Ccdc18Q640L5 Gm27285-201ENSMUST00000183875 127 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC-4.51□□□□□ -3.13
Ccdc18Q640L5 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC-4.51□□□□□ -3.13
Ccdc18Q640L5 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC-4.51□□□□□ -3.13
Ccdc18Q640L5 Mir192-201ENSMUST00000083589 89 ntBASIC-4.51□□□□□ -3.13
Ccdc18Q640L5 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
Ccdc18Q640L5 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
Ccdc18Q640L5 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
Ccdc18Q640L5 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
Ccdc18Q640L5 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
Ccdc18Q640L5 Traj61-201ENSMUST00000165025 72 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
Ccdc18Q640L5 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC-4.53□□□□□ -3.13
Ccdc18Q640L5 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC-4.56□□□□□ -3.14
Ccdc18Q640L5 Mir6395-201ENSMUST00000183885 91 ntBASIC-4.56□□□□□ -3.14
Ccdc18Q640L5 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC-4.56□□□□□ -3.14
Ccdc18Q640L5 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC-4.56□□□□□ -3.14
Ccdc18Q640L5 Gm23352-201ENSMUST00000158428 64 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
Ccdc18Q640L5 Gm24707-201ENSMUST00000082812 107 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
Ccdc18Q640L5 Gm24070-201ENSMUST00000104519 130 ntBASIC-4.58□□□□□ -3.14
Ccdc18Q640L5 Gm12013-201ENSMUST00000121971 155 ntBASIC-4.58□□□□□ -3.14
Ccdc18Q640L5 Gm23066-201ENSMUST00000158237 71 ntBASIC-4.58□□□□□ -3.14
Ccdc18Q640L5 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC-4.58□□□□□ -3.14
Ccdc18Q640L5 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC-4.58□□□□□ -3.14
Ccdc18Q640L5 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC-4.59□□□□□ -3.14
Ccdc18Q640L5 Gm23306-201ENSMUST00000179058 105 ntBASIC-4.6□□□□□ -3.15
Ccdc18Q640L5 Mir201-201ENSMUST00000083470 66 ntBASIC-4.6□□□□□ -3.15
Ccdc18Q640L5 Gm29817-201ENSMUST00000210098 172 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC-4.62□□□□□ -3.15
Ccdc18Q640L5 AC157602.1-201ENSMUST00000197446 105 ntBASIC-4.62□□□□□ -3.15
Ccdc18Q640L5 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC-4.62□□□□□ -3.15
Ccdc18Q640L5 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC-4.62□□□□□ -3.15
Ccdc18Q640L5 Mir5619-201ENSMUST00000176065 61 ntBASIC-4.62□□□□□ -3.15
Ccdc18Q640L5 Gm22459-201ENSMUST00000082577 108 ntBASIC-4.62□□□□□ -3.15
Ccdc18Q640L5 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC-4.62□□□□□ -3.15
Ccdc18Q640L5 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC-4.63□□□□□ -3.15
Ccdc18Q640L5 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC-4.63□□□□□ -3.15
Ccdc18Q640L5 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC-4.63□□□□□ -3.15
Ccdc18Q640L5 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC-4.64□□□□□ -3.15
Ccdc18Q640L5 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC-4.65□□□□□ -3.15
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