Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC1,74□□□□□ -2,13
Rtp3Q5QGU6 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC1,73□□□□□ -2,13
Rtp3Q5QGU6 Gm25886-201ENSMUST00000157780 114 ntBASIC1,73□□□□□ -2,13
Rtp3Q5QGU6 Gm25641-201ENSMUST00000175135 108 ntBASIC1,73□□□□□ -2,13
Rtp3Q5QGU6 Gm27993-201ENSMUST00000184362 85 ntBASIC1,73□□□□□ -2,13
Rtp3Q5QGU6 AC238676.2-201ENSMUST00000220910 94 ntBASIC1,73□□□□□ -2,13
Rtp3Q5QGU6 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,72□□□□□ -2,13
Rtp3Q5QGU6 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,72□□□□□ -2,13
Rtp3Q5QGU6 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
Rtp3Q5QGU6 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
Rtp3Q5QGU6 Snord2-201ENSMUST00000157899 69 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
Rtp3Q5QGU6 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
Rtp3Q5QGU6 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
Rtp3Q5QGU6 Gm25730-201ENSMUST00000178753 165 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
Rtp3Q5QGU6 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
Rtp3Q5QGU6 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
Rtp3Q5QGU6 Gm29432-201ENSMUST00000185397 139 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
Rtp3Q5QGU6 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
Rtp3Q5QGU6 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
Rtp3Q5QGU6 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
Rtp3Q5QGU6 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
Rtp3Q5QGU6 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC1,71□□□□□ -2,14
Rtp3Q5QGU6 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC1,71□□□□□ -2,14
Rtp3Q5QGU6 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,71□□□□□ -2,14
Rtp3Q5QGU6 Gm23991-201ENSMUST00000117033 93 ntBASIC1,7□□□□□ -2,14
Rtp3Q5QGU6 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC1,7□□□□□ -2,14
Rtp3Q5QGU6 Gm27937-201ENSMUST00000183605 88 ntBASIC1,7□□□□□ -2,14
Rtp3Q5QGU6 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC1,7□□□□□ -2,14
Rtp3Q5QGU6 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC1,69□□□□□ -2,14
Rtp3Q5QGU6 Gm22717-201ENSMUST00000122703 171 ntBASIC1,69□□□□□ -2,14
Rtp3Q5QGU6 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC1,69□□□□□ -2,14
Rtp3Q5QGU6 Gm22474-201ENSMUST00000179407 107 ntBASIC1,69□□□□□ -2,14
Rtp3Q5QGU6 Mir7673-201ENSMUST00000184567 64 ntBASIC1,69□□□□□ -2,14
Rtp3Q5QGU6 Gm29344-201ENSMUST00000068143 210 ntBASIC1,69□□□□□ -2,14
Rtp3Q5QGU6 Mir669a-3-201ENSMUST00000102074 109 ntBASIC1,68□□□□□ -2,14
Rtp3Q5QGU6 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1,68□□□□□ -2,14
Rtp3Q5QGU6 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC1,68□□□□□ -2,14
Rtp3Q5QGU6 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1,68□□□□□ -2,14
Rtp3Q5QGU6 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC1,67□□□□□ -2,14
Rtp3Q5QGU6 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC1,67□□□□□ -2,14
Rtp3Q5QGU6 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC1,67□□□□□ -2,14
Rtp3Q5QGU6 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC1,67□□□□□ -2,14
Rtp3Q5QGU6 Gm22459-201ENSMUST00000082577 108 ntBASIC1,67□□□□□ -2,14
Rtp3Q5QGU6 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,67□□□□□ -2,14
Rtp3Q5QGU6 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1,67□□□□□ -2,14
Rtp3Q5QGU6 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC1,66□□□□□ -2,14
Rtp3Q5QGU6 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC1,66□□□□□ -2,14
Rtp3Q5QGU6 Gm25010-201ENSMUST00000158403 65 ntBASIC1,66□□□□□ -2,14
Rtp3Q5QGU6 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC1,66□□□□□ -2,14
Rtp3Q5QGU6 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1,66□□□□□ -2,14
Rtp3Q5QGU6 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC1,66□□□□□ -2,14
Rtp3Q5QGU6 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC1,66□□□□□ -2,14
Rtp3Q5QGU6 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC1,66□□□□□ -2,14
Rtp3Q5QGU6 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC1,65□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC1,65□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC1,65□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,65□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC1,64□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC1,64□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC1,64□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 C920009B18Rik-204ENSMUST00000181733 123 ntBASIC1,64□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC1,64□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC1,64□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1,64□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Gm22494-201ENSMUST00000104495 128 ntBASIC1,63□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Gm24531-201ENSMUST00000157945 100 ntBASIC1,63□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Gm22541-201ENSMUST00000158165 127 ntBASIC1,63□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Gm24229-201ENSMUST00000158830 118 ntBASIC1,63□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC1,63□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC1,63□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC1,63□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC1,63□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Gm23961-201ENSMUST00000104685 97 ntBASIC1,62□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Gm25663-201ENSMUST00000157698 135 ntBASIC1,62□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Gm24996-201ENSMUST00000158390 99 ntBASIC1,62□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC1,62□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Gm26259-201ENSMUST00000104778 97 ntBASIC1,61□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Gm24797-201ENSMUST00000178103 107 ntBASIC1,61□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Mir376b-201ENSMUST00000195930 82 ntBASIC1,61□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC1,61□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC1,61□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Gm25440-201ENSMUST00000158279 154 ntBASIC1,6□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1,6□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC1,6□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC1,6□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC1,6□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC1,6□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC1,6□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Gm25040-201ENSMUST00000103877 66 ntBASIC1,59□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC1,59□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC1,59□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,59□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC1,59□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC1,59□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 Mir3071-201ENSMUST00000093621 80 ntBASIC1,59□□□□□ -2,15
Rtp3Q5QGU6 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC1,58□□□□□ -2,16
Rtp3Q5QGU6 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC1,58□□□□□ -2,16
Rtp3Q5QGU6 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC1,58□□□□□ -2,16
Rtp3Q5QGU6 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC1,58□□□□□ -2,16
Rtp3Q5QGU6 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC1,58□□□□□ -2,16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132,8 ms