Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC3,55□□□□□ -1,84
Hoxd11P23813 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC3,54□□□□□ -1,84
Hoxd11P23813 Gm14684-201ENSMUST00000145722 123 ntTSL 5 BASIC3,54□□□□□ -1,84
Hoxd11P23813 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC3,54□□□□□ -1,84
Hoxd11P23813 AC129019.2-201ENSMUST00000222063 202 ntBASIC3,54□□□□□ -1,84
Hoxd11P23813 Csmd3-204ENSMUST00000160658 12460 ntTSL 5 BASIC3,54□□□□□ -1,84
Hoxd11P23813 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3,53□□□□□ -1,84
Hoxd11P23813 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3,53□□□□□ -1,84
Hoxd11P23813 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC3,53□□□□□ -1,84
Hoxd11P23813 Gm22673-201ENSMUST00000104415 131 ntBASIC3,53□□□□□ -1,84
Hoxd11P23813 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC3,53□□□□□ -1,84
Hoxd11P23813 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC3,53□□□□□ -1,84
Hoxd11P23813 Olfr592-203ENSMUST00000218618 5978 ntTSL 5 BASIC3,53□□□□□ -1,85
Hoxd11P23813 Macf1-206ENSMUST00000106224 23402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3,52□□□□□ -1,85
Hoxd11P23813 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3,51□□□□□ -1,85
Hoxd11P23813 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC3,51□□□□□ -1,85
Hoxd11P23813 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC3,51□□□□□ -1,85
Hoxd11P23813 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC3,51□□□□□ -1,85
Hoxd11P23813 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC3,51□□□□□ -1,85
Hoxd11P23813 Gm22056-201ENSMUST00000083386 81 ntBASIC3,51□□□□□ -1,85
Hoxd11P23813 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC3,51□□□□□ -1,85
Hoxd11P23813 Ntrk3-201ENSMUST00000039431 19703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3,5□□□□□ -1,85
Hoxd11P23813 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC3,5□□□□□ -1,85
Hoxd11P23813 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC3,5□□□□□ -1,85
Hoxd11P23813 Mir1949-202ENSMUST00000199259 70 ntBASIC3,5□□□□□ -1,85
Hoxd11P23813 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC3,5□□□□□ -1,85
Hoxd11P23813 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC3,5□□□□□ -1,85
Hoxd11P23813 Nbeal1-203ENSMUST00000160834 15731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3,49□□□□□ -1,85
Hoxd11P23813 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC3,49□□□□□ -1,85
Hoxd11P23813 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC3,48□□□□□ -1,85
Hoxd11P23813 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC3,48□□□□□ -1,85
Hoxd11P23813 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC3,47□□□□□ -1,85
Hoxd11P23813 Vmn1r81-203ENSMUST00000227973 14002 ntAPPRIS P2 BASIC3,47□□□□□ -1,85
Hoxd11P23813 Syne2-210ENSMUST00000143031 21704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3,47□□□□□ -1,85
Hoxd11P23813 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC3,47□□□□□ -1,85
Hoxd11P23813 AC138401.2-201ENSMUST00000220461 365 ntBASIC3,47□□□□□ -1,85
Hoxd11P23813 Gm22472-201ENSMUST00000104115 134 ntBASIC3,46□□□□□ -1,86
Hoxd11P23813 Gm25663-201ENSMUST00000157698 135 ntBASIC3,46□□□□□ -1,86
Hoxd11P23813 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC3,46□□□□□ -1,86
Hoxd11P23813 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC3,46□□□□□ -1,86
Hoxd11P23813 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3,46□□□□□ -1,86
Hoxd11P23813 St8sia4-204ENSMUST00000189556 10027 ntTSL 1 (best) BASIC3,45□□□□□ -1,86
Hoxd11P23813 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC3,45□□□□□ -1,86
Hoxd11P23813 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC3,45□□□□□ -1,86
Hoxd11P23813 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC3,45□□□□□ -1,86
Hoxd11P23813 Fsip2-203ENSMUST00000143764 21116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3,44□□□□□ -1,86
Hoxd11P23813 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC3,44□□□□□ -1,86
Hoxd11P23813 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC3,44□□□□□ -1,86
Hoxd11P23813 Gm23017-201ENSMUST00000177583 72 ntBASIC3,44□□□□□ -1,86
Hoxd11P23813 Mir466f-1-201ENSMUST00000104779 94 ntBASIC3,43□□□□□ -1,86
Hoxd11P23813 Gm25730-201ENSMUST00000178753 165 ntBASIC3,43□□□□□ -1,86
Hoxd11P23813 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC3,43□□□□□ -1,86
Hoxd11P23813 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC3,43□□□□□ -1,86
Hoxd11P23813 Olfr1183-203ENSMUST00000219871 8353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3,43□□□□□ -1,86
Hoxd11P23813 Pkhd1l1-202ENSMUST00000166957 12747 ntTSL 5 BASIC3,42□□□□□ -1,86
Hoxd11P23813 Pkhd1l1-201ENSMUST00000038336 12741 ntTSL 1 (best) BASIC3,42□□□□□ -1,86
Hoxd11P23813 Gm24233-201ENSMUST00000104317 122 ntBASIC3,41□□□□□ -1,86
Hoxd11P23813 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC3,41□□□□□ -1,86
Hoxd11P23813 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC3,41□□□□□ -1,86
Hoxd11P23813 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC3,4□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 Gm23592-201ENSMUST00000157859 117 ntBASIC3,4□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC3,4□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC3,4□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC3,4□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 Ankrd28-207ENSMUST00000227863 6616 ntAPPRIS ALT1 BASIC3,4□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 Gm24796-201ENSMUST00000104007 107 ntBASIC3,39□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC3,39□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 Mir23a-201ENSMUST00000083677 75 ntBASIC3,39□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC3,38□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 AF357341-201ENSMUST00000083088 75 ntBASIC3,38□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 Vmn1r74-202ENSMUST00000228471 6608 ntAPPRIS P1 BASIC3,38□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3,38□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 Vmn1r46-204ENSMUST00000228231 13338 ntAPPRIS P1 BASIC3,37□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC3,37□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC3,37□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 Gm23753-201ENSMUST00000157575 149 ntBASIC3,37□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 Gm23410-201ENSMUST00000179967 107 ntBASIC3,37□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC3,37□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 Gm22505-201ENSMUST00000082956 108 ntBASIC3,37□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC3,37□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC3,37□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 Csmd3-209ENSMUST00000162830 13012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3,37□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 Gm23231-201ENSMUST00000157299 104 ntBASIC3,36□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC3,36□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC3,36□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 Pik3ca-201ENSMUST00000029201 8917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3,36□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC3,35□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 Gm23494-201ENSMUST00000116830 126 ntBASIC3,35□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps69-201ENSMUST00000172759 201 ntBASIC3,35□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 Gm25993-201ENSMUST00000175391 80 ntBASIC3,35□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 Mir6715-201ENSMUST00000184990 57 ntBASIC3,35□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC3,35□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC3,35□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 Dst-201ENSMUST00000097785 23251 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3,35□□□□□ -1,87
Hoxd11P23813 Obscn-203ENSMUST00000052872 23006 ntTSL 5 BASIC3,34□□□□□ -1,88
Hoxd11P23813 Gm37158-201ENSMUST00000191652 5704 ntBASIC3,33□□□□□ -1,88
Hoxd11P23813 Gm22720-201ENSMUST00000122710 87 ntBASIC3,33□□□□□ -1,88
Hoxd11P23813 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC3,33□□□□□ -1,88
Hoxd11P23813 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC3,33□□□□□ -1,88
Hoxd11P23813 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC3,32□□□□□ -1,88
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