Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm27699-201ENSMUST00000183553 180 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Gm26438-201ENSMUST00000082593 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Gm23442-201ENSMUST00000082919 134 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Gm23507-201ENSMUST00000083078 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Gm23344-201ENSMUST00000083818 68 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Mir466b-3-201ENSMUST00000103806 81 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Gm22720-201ENSMUST00000122710 87 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Gm22203-201ENSMUST00000158605 58 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Mir196a-2-201ENSMUST00000083554 85 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Gm25370-201ENSMUST00000158159 94 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Gm25633-201ENSMUST00000178565 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Gm44375-201ENSMUST00000196657 150 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Gm43324-201ENSMUST00000197482 289 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 7330423F06Rik-201ENSMUST00000197499 301 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Gm25337-201ENSMUST00000083723 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Gm24843-201ENSMUST00000158682 76 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Gm25993-201ENSMUST00000175391 80 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 AC158982.2-201ENSMUST00000226283 184 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Mir29a-201ENSMUST00000083676 88 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Snord78-201ENSMUST00000104032 66 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Gm22212-201ENSMUST00000158096 106 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Mir126a-201ENSMUST00000083606 73 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Snord64-201ENSMUST00000104003 67 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ccl20O89093 Mir509-201ENSMUST00000196089 75 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ccl20O89093 Gm44322-201ENSMUST00000196830 115 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ccl20O89093 Gm24983-201ENSMUST00000104457 69 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ccl20O89093 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ccl20O89093 Gm22319-201ENSMUST00000157147 122 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ccl20O89093 Gm22542-201ENSMUST00000158166 95 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ccl20O89093 Gm25307-201ENSMUST00000158885 106 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ccl20O89093 Gm22324-201ENSMUST00000158903 114 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ccl20O89093 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccl20O89093 Snord67-201ENSMUST00000104033 111 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccl20O89093 Gm26478-201ENSMUST00000122611 133 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccl20O89093 Gm14947-201ENSMUST00000133704 303 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccl20O89093 Gm25887-201ENSMUST00000157777 84 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccl20O89093 Gm24903-201ENSMUST00000158131 126 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccl20O89093 Gm25656-201ENSMUST00000158466 66 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccl20O89093 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccl20O89093 AC164561.1-201ENSMUST00000220414 115 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccl20O89093 Gm25296-201ENSMUST00000082566 67 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccl20O89093 n-R5s171-201ENSMUST00000104128 79 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ccl20O89093 Gm12086-201ENSMUST00000120863 228 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ccl20O89093 Gm22558-201ENSMUST00000157326 95 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ccl20O89093 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ccl20O89093 Gm24657-201ENSMUST00000180085 79 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ccl20O89093 Gm22996-201ENSMUST00000180236 79 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ccl20O89093 Gm38298-201ENSMUST00000193578 118 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ccl20O89093 Traj43-201ENSMUST00000103699 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ccl20O89093 Gm25149-201ENSMUST00000157119 82 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ccl20O89093 Gm22406-201ENSMUST00000174923 93 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ccl20O89093 Gm45429-201ENSMUST00000209527 172 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ccl20O89093 Gm24202-201ENSMUST00000082948 103 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ccl20O89093 Gm24256-201ENSMUST00000083696 84 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ccl20O89093 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ccl20O89093 Gm24947-201ENSMUST00000158334 110 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
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Ccl20O89093 Gm25071-201ENSMUST00000175232 70 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
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Ccl20O89093 AC157602.1-201ENSMUST00000197446 105 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
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Ccl20O89093 Gm23715-201ENSMUST00000157354 106 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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Ccl20O89093 AC165138.1-201ENSMUST00000226984 270 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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Ccl20O89093 mt-Tw-201ENSMUST00000082397 67 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ccl20O89093 Gm43885-201ENSMUST00000204928 2542 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ccl20O89093 Snord91a-201ENSMUST00000104305 93 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
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Ccl20O89093 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
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Ccl20O89093 AL845349.1-201ENSMUST00000213794 78 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ccl20O89093 mt-Tn-201ENSMUST00000082399 71 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ccl20O89093 Mirlet7a-1-201ENSMUST00000083487 94 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ccl20O89093 Gm24697-201ENSMUST00000083881 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ccl20O89093 Gm25186-201ENSMUST00000083909 108 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ccl20O89093 Gm24468-201ENSMUST00000104489 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ccl20O89093 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ccl20O89093 Gm25889-201ENSMUST00000157775 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ccl20O89093 Mir6237-201ENSMUST00000183808 91 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
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Ccl20O89093 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ccl20O89093 Gm10351-201ENSMUST00000087694 125 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ccl20O89093 Gm25425-201ENSMUST00000157611 96 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ccl20O89093 Mir7038-201ENSMUST00000184833 71 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ccl20O89093 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ccl20O89093 Gm6358-201ENSMUST00000089101 156 ntAPPRIS ALT2 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ccl20O89093 Gm24683-201ENSMUST00000104840 88 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
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