Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

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Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ApobE9Q414 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ApobE9Q414 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
ApobE9Q414 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
ApobE9Q414 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
ApobE9Q414 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
ApobE9Q414 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
ApobE9Q414 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
ApobE9Q414 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
ApobE9Q414 Gm25074-201ENSMUST00000178782 94 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
ApobE9Q414 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
ApobE9Q414 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
ApobE9Q414 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
ApobE9Q414 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ApobE9Q414 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ApobE9Q414 Gm24801-201ENSMUST00000178503 105 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ApobE9Q414 Traj53-201ENSMUST00000103690 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2.38□□□□□ -2.79
ApobE9Q414 Gm12013-201ENSMUST00000121971 155 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ApobE9Q414 Gm23080-201ENSMUST00000157846 103 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ApobE9Q414 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ApobE9Q414 Gm25635-201ENSMUST00000082675 131 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ApobE9Q414 Traj61-201ENSMUST00000165025 72 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ApobE9Q414 Gm45655-201ENSMUST00000211625 160 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ApobE9Q414 Gm23461-201ENSMUST00000083265 107 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ApobE9Q414 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ApobE9Q414 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ApobE9Q414 Gm26472-201ENSMUST00000116760 83 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ApobE9Q414 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ApobE9Q414 Gm25903-201ENSMUST00000158492 103 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ApobE9Q414 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ApobE9Q414 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
ApobE9Q414 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
ApobE9Q414 Gm22717-201ENSMUST00000122703 171 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 AC120394.1-201ENSMUST00000217153 351 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 Gm23986-201ENSMUST00000157144 63 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 Gm23320-201ENSMUST00000104462 127 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 Gm24502-201ENSMUST00000158453 105 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 Gm23811-201ENSMUST00000175155 84 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 Mir466q-201ENSMUST00000175249 76 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 Gm24871-201ENSMUST00000083099 116 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 Mir28c-201ENSMUST00000200096 75 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 Gm25563-201ENSMUST00000104603 74 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 Mir493-201ENSMUST00000103837 83 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 Gm23543-201ENSMUST00000158207 106 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 Mir1906-1-201ENSMUST00000122586 80 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 Mir1906-2-201ENSMUST00000122610 80 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 Gm44347-201ENSMUST00000199602 108 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 Mir201-201ENSMUST00000083470 66 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 Gm22232-201ENSMUST00000104654 94 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 Gm27942-201ENSMUST00000184669 101 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
ApobE9Q414 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
ApobE9Q414 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ApobE9Q414 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ApobE9Q414 Gm44409-201ENSMUST00000198810 166 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ApobE9Q414 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ApobE9Q414 Gm27549-201ENSMUST00000183508 62 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ApobE9Q414 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC-2.48□□□□□ -2.81
ApobE9Q414 Gm25367-201ENSMUST00000158846 106 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ApobE9Q414 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ApobE9Q414 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ApobE9Q414 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ApobE9Q414 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ApobE9Q414 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ApobE9Q414 Gm25450-201ENSMUST00000179144 107 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ApobE9Q414 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ApobE9Q414 Gm23093-201ENSMUST00000083450 102 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ApobE9Q414 Mir181b-1-201ENSMUST00000083524 80 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ApobE9Q414 Gm22602-201ENSMUST00000157596 95 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ApobE9Q414 Gm44932-201ENSMUST00000206799 121 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ApobE9Q414 Gm24646-201ENSMUST00000157109 99 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ApobE9Q414 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ApobE9Q414 Gm25143-201ENSMUST00000082696 109 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ApobE9Q414 Gm11084-201ENSMUST00000112062 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-2.51□□□□□ -2.81
ApobE9Q414 Gm26375-201ENSMUST00000101829 106 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ApobE9Q414 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ApobE9Q414 Gm25964-201ENSMUST00000157171 97 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ApobE9Q414 Gm24201-201ENSMUST00000082946 125 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ApobE9Q414 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ApobE9Q414 Gm22348-201ENSMUST00000178674 79 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ApobE9Q414 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ApobE9Q414 Gm23474-201ENSMUST00000158884 75 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ApobE9Q414 Gm24134-201ENSMUST00000083361 71 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
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