Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Lmx1aQ9JKU8 AC124687.1-201ENSMUST00000221868 189 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Lmx1aQ9JKU8 Snord91a-201ENSMUST00000104305 93 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Lmx1aQ9JKU8 Gm25802-201ENSMUST00000082639 77 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Lmx1aQ9JKU8 Gm23442-201ENSMUST00000082919 134 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Lmx1aQ9JKU8 Gm26007-201ENSMUST00000158798 120 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Lmx1aQ9JKU8 Traj61-201ENSMUST00000165025 72 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Lmx1aQ9JKU8 Mir344-2-201ENSMUST00000175446 80 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Lmx1aQ9JKU8 Gm25596-201ENSMUST00000178368 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Lmx1aQ9JKU8 Gm26097-201ENSMUST00000179642 93 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Lmx1aQ9JKU8 AL845349.1-201ENSMUST00000213794 78 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Lmx1aQ9JKU8 Snord49b-201ENSMUST00000082503 72 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Lmx1aQ9JKU8 Gm23461-201ENSMUST00000083265 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Lmx1aQ9JKU8 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Lmx1aQ9JKU8 Gm23654-201ENSMUST00000116758 126 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Lmx1aQ9JKU8 Gm25149-201ENSMUST00000157119 82 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Lmx1aQ9JKU8 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Lmx1aQ9JKU8 Gm22838-201ENSMUST00000158437 99 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Lmx1aQ9JKU8 Mir21c-201ENSMUST00000184910 78 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Lmx1aQ9JKU8 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Lmx1aQ9JKU8 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Lmx1aQ9JKU8 Mir487b-201ENSMUST00000102265 82 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm24587-201ENSMUST00000116697 89 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm24073-201ENSMUST00000158177 106 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm25160-201ENSMUST00000158914 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm23504-201ENSMUST00000158988 95 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 AC154506.4-201ENSMUST00000224898 3416 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm24887-201ENSMUST00000104386 108 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm25338-201ENSMUST00000116849 120 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm25899-201ENSMUST00000082672 141 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm23690-201ENSMUST00000083036 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm22607-201ENSMUST00000158291 105 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm38295-201ENSMUST00000191951 151 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm23012-201ENSMUST00000104149 83 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm12013-201ENSMUST00000121971 155 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm23260-201ENSMUST00000158317 172 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm22089-201ENSMUST00000158336 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm37545-201ENSMUST00000186512 148 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Traj9-201ENSMUST00000103731 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm24468-201ENSMUST00000104489 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm25056-201ENSMUST00000157372 62 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm24843-201ENSMUST00000158682 76 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm25366-201ENSMUST00000158845 124 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm25032-201ENSMUST00000175411 84 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm44375-201ENSMUST00000196657 150 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm43907-201ENSMUST00000203128 117 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm24461-201ENSMUST00000082735 103 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm23483-201ENSMUST00000104179 108 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm22489-201ENSMUST00000116813 62 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm23900-201ENSMUST00000157569 108 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm23209-201ENSMUST00000158667 110 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm22324-201ENSMUST00000158903 114 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Mir669j-201ENSMUST00000179023 121 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm27735-201ENSMUST00000185085 76 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Snora16a-202ENSMUST00000196061 137 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Lmx1aQ9JKU8 Mir764-201ENSMUST00000103259 108 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Gm22451-201ENSMUST00000122803 151 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Snord2-201ENSMUST00000157899 69 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Gm37750-201ENSMUST00000193563 129 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 AC125190.3-201ENSMUST00000223224 121 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Gm23947-201ENSMUST00000093636 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Gm26133-201ENSMUST00000157363 100 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Mir7038-201ENSMUST00000184833 71 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Gm24894-201ENSMUST00000122744 118 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Gm24718-201ENSMUST00000157521 136 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Mir7651-201ENSMUST00000184154 64 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Gm22720-201ENSMUST00000122710 87 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Gm24246-201ENSMUST00000157315 132 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Gm25471-201ENSMUST00000180126 94 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Snord67-201ENSMUST00000104033 111 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Gm24399-201ENSMUST00000157869 74 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Gm23291-201ENSMUST00000175611 78 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Lmx1aQ9JKU8 Mup-ps5-201ENSMUST00000118667 99 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
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