Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Chmp3Q9CQ10 Gm25644-201ENSMUST00000083209 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Chmp3Q9CQ10 Gm22753-201ENSMUST00000083657 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Chmp3Q9CQ10 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Chmp3Q9CQ10 Gm25056-201ENSMUST00000157372 62 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Chmp3Q9CQ10 Gm24009-201ENSMUST00000157734 93 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Chmp3Q9CQ10 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Chmp3Q9CQ10 Gm24129-201ENSMUST00000158537 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Chmp3Q9CQ10 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Chmp3Q9CQ10 Snora26-201ENSMUST00000175614 121 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Chmp3Q9CQ10 Gm36956-201ENSMUST00000193830 214 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Chmp3Q9CQ10 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Chmp3Q9CQ10 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Chmp3Q9CQ10 Gm26478-201ENSMUST00000122611 133 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Chmp3Q9CQ10 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Chmp3Q9CQ10 Gm24547-201ENSMUST00000158649 149 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Chmp3Q9CQ10 Gm24162-201ENSMUST00000093665 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Chmp3Q9CQ10 Gm25974-201ENSMUST00000158701 94 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Chmp3Q9CQ10 Gm26202-201ENSMUST00000082910 65 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Chmp3Q9CQ10 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Chmp3Q9CQ10 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
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Chmp3Q9CQ10 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Chmp3Q9CQ10 Gm24946-201ENSMUST00000158332 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Chmp3Q9CQ10 Mup-ps5-201ENSMUST00000118667 99 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Chmp3Q9CQ10 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Chmp3Q9CQ10 Mir509-201ENSMUST00000196089 75 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Chmp3Q9CQ10 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Chmp3Q9CQ10 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Chmp3Q9CQ10 Gm25542-201ENSMUST00000116889 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Chmp3Q9CQ10 Mir1187-201ENSMUST00000116936 122 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Chmp3Q9CQ10 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Chmp3Q9CQ10 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Chmp3Q9CQ10 Gm25322-201ENSMUST00000122556 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Chmp3Q9CQ10 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Chmp3Q9CQ10 Gm27297-201ENSMUST00000183395 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Chmp3Q9CQ10 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.1
Chmp3Q9CQ10 Traj42-201ENSMUST00000103700 64 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Chmp3Q9CQ10 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Chmp3Q9CQ10 Gm25693-201ENSMUST00000175443 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Chmp3Q9CQ10 Gm27993-201ENSMUST00000184362 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Chmp3Q9CQ10 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Chmp3Q9CQ10 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Chmp3Q9CQ10 Gm25854-201ENSMUST00000082792 72 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Chmp3Q9CQ10 Gm37824-201ENSMUST00000193430 3236 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Chmp3Q9CQ10 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Chmp3Q9CQ10 Gm25740-201ENSMUST00000180247 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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Chmp3Q9CQ10 Gm43927-201ENSMUST00000204599 117 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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Chmp3Q9CQ10 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Chmp3Q9CQ10 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Chmp3Q9CQ10 Mirlet7a-1-201ENSMUST00000083487 94 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Chmp3Q9CQ10 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Chmp3Q9CQ10 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Chmp3Q9CQ10 Gm27987-201ENSMUST00000184023 93 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Chmp3Q9CQ10 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Chmp3Q9CQ10 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Chmp3Q9CQ10 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Chmp3Q9CQ10 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Chmp3Q9CQ10 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Chmp3Q9CQ10 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Chmp3Q9CQ10 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Chmp3Q9CQ10 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Chmp3Q9CQ10 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Chmp3Q9CQ10 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Chmp3Q9CQ10 Mir34c-201ENSMUST00000083653 77 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Chmp3Q9CQ10 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Chmp3Q9CQ10 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Chmp3Q9CQ10 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Chmp3Q9CQ10 Gm24064-201ENSMUST00000157486 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Chmp3Q9CQ10 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Chmp3Q9CQ10 Gm22522-201ENSMUST00000158271 151 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Chmp3Q9CQ10 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Chmp3Q9CQ10 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Chmp3Q9CQ10 Mir216b-201ENSMUST00000102363 86 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Chmp3Q9CQ10 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Chmp3Q9CQ10 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Chmp3Q9CQ10 AC122335.1-201ENSMUST00000217587 175 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Chmp3Q9CQ10 Gm23293-201ENSMUST00000082552 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Chmp3Q9CQ10 Gm23056-201ENSMUST00000082803 111 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Chmp3Q9CQ10 Gm24868-201ENSMUST00000157265 136 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Chmp3Q9CQ10 Gm24077-201ENSMUST00000158183 136 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Chmp3Q9CQ10 Gm28435-201ENSMUST00000185496 108 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Chmp3Q9CQ10 Gm29047-201ENSMUST00000189816 108 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Chmp3Q9CQ10 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Chmp3Q9CQ10 Gm24199-201ENSMUST00000157808 136 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Chmp3Q9CQ10 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Chmp3Q9CQ10 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Chmp3Q9CQ10 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Chmp3Q9CQ10 Gm22788-201ENSMUST00000157876 61 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Chmp3Q9CQ10 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Chmp3Q9CQ10 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Chmp3Q9CQ10 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Chmp3Q9CQ10 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Chmp3Q9CQ10 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Chmp3Q9CQ10 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Chmp3Q9CQ10 Gm26207-201ENSMUST00000082909 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Chmp3Q9CQ10 Gm25417-201ENSMUST00000104212 131 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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