Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd9P28357 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd9P28357 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd9P28357 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd9P28357 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd9P28357 Gm6985-201ENSMUST00000121255 271 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd9P28357 Gm22039-201ENSMUST00000157278 132 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd9P28357 Gm25183-201ENSMUST00000157752 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd9P28357 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd9P28357 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd9P28357 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd9P28357 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd9P28357 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Hoxd9P28357 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Hoxd9P28357 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Hoxd9P28357 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Hoxd9P28357 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Hoxd9P28357 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Hoxd9P28357 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Gm23649-201ENSMUST00000179007 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Gm24134-201ENSMUST00000083361 71 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Gm25524-201ENSMUST00000101821 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Gm24984-201ENSMUST00000104454 133 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Gm26139-201ENSMUST00000180098 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Gm44469-201ENSMUST00000198558 79 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Trgj1-201ENSMUST00000200495 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Gm24927-201ENSMUST00000083397 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Mir126a-201ENSMUST00000083606 73 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Gm23347-201ENSMUST00000083823 82 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Gm23672-201ENSMUST00000157471 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Gm24129-201ENSMUST00000158537 97 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Gm26202-201ENSMUST00000082910 65 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 n-R5s63-201ENSMUST00000122756 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Gm23291-201ENSMUST00000175611 78 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Gm25366-201ENSMUST00000158845 124 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Gm28862-201ENSMUST00000188246 163 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Gm25186-201ENSMUST00000083909 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Gm25974-201ENSMUST00000158701 94 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Hoxd9P28357 Gm22788-201ENSMUST00000157876 61 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 Gm22100-201ENSMUST00000157926 63 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 Gm22406-201ENSMUST00000174923 93 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 Gm23630-201ENSMUST00000175292 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 Gm43907-201ENSMUST00000203128 117 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 Gm25693-201ENSMUST00000175443 85 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 Gm23500-201ENSMUST00000157735 98 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 Gm27554-201ENSMUST00000185074 98 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 Gm24983-201ENSMUST00000104457 69 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 Gm23072-201ENSMUST00000158243 123 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Hoxd9P28357 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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