Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm22505-201ENSMUST00000082956 108 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm23012-201ENSMUST00000104149 83 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm22708-201ENSMUST00000158987 103 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Mir1197-201ENSMUST00000117037 120 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm24141-201ENSMUST00000122776 115 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm24649-201ENSMUST00000157106 134 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm24399-201ENSMUST00000157869 74 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm22089-201ENSMUST00000158336 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm26007-201ENSMUST00000158798 120 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm43907-201ENSMUST00000203128 117 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm24686-201ENSMUST00000157755 93 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm25366-201ENSMUST00000158845 124 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Mir219b-201ENSMUST00000198317 65 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm22772-201ENSMUST00000104451 121 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm24717-201ENSMUST00000157522 124 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm23900-201ENSMUST00000157569 108 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm45492-201ENSMUST00000211611 288 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm25756-201ENSMUST00000103990 136 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm24796-201ENSMUST00000104007 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Snord2-201ENSMUST00000157899 69 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm23159-201ENSMUST00000175088 77 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Ranbp2-ps1-201ENSMUST00000184001 403 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm25635-201ENSMUST00000082675 131 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm26133-201ENSMUST00000157363 100 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm23065-201ENSMUST00000158236 130 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm26712-201ENSMUST00000180813 217 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Mir3065-201ENSMUST00000198674 87 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm44328-201ENSMUST00000199331 75 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm22813-201ENSMUST00000199948 123 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 n-R5s42-201ENSMUST00000082697 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Mir382-201ENSMUST00000083494 76 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm24449-201ENSMUST00000083985 106 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm23126-201ENSMUST00000104260 134 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm23986-201ENSMUST00000157144 63 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm22349-201ENSMUST00000157864 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm25014-201ENSMUST00000158401 103 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm22431-201ENSMUST00000158545 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm22638-201ENSMUST00000179674 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 mt-Atp8-201ENSMUST00000082407 204 ntAPPRIS P1 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm24842-201ENSMUST00000158681 54 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm22775-201ENSMUST00000177630 120 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm23569-201ENSMUST00000180120 120 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm22681-201ENSMUST00000083853 106 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm25328-201ENSMUST00000175013 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm23291-201ENSMUST00000175611 78 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm37750-201ENSMUST00000193563 129 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 AC154506.4-201ENSMUST00000224898 3416 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Traj9-201ENSMUST00000103731 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm22196-201ENSMUST00000116865 109 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Mup-ps5-201ENSMUST00000118667 99 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm25623-201ENSMUST00000157216 108 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm23601-201ENSMUST00000157259 131 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm22838-201ENSMUST00000158437 99 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm23384-201ENSMUST00000158593 103 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm27851-201ENSMUST00000183529 63 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Mir6896-201ENSMUST00000198033 73 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Mir327-201ENSMUST00000199328 69 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm26062-201ENSMUST00000083379 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm24379-201ENSMUST00000122695 86 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm25160-201ENSMUST00000158914 102 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm22503-201ENSMUST00000158983 115 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm27928-201ENSMUST00000183747 256 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm29432-201ENSMUST00000185397 139 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm25401-201ENSMUST00000082975 106 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm23722-201ENSMUST00000083002 130 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Mir142b-201ENSMUST00000083486 115 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Snord80-201ENSMUST00000083801 81 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm24263-201ENSMUST00000104059 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Gm25055-201ENSMUST00000157369 76 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Gm22336-201ENSMUST00000157719 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Gm26210-201ENSMUST00000158680 91 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Mir344-2-201ENSMUST00000175446 80 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Gm26498-201ENSMUST00000177799 79 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Gm25618-201ENSMUST00000179484 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Gm26230-201ENSMUST00000180141 79 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 AC125190.3-201ENSMUST00000223224 121 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Gm26395-201ENSMUST00000104094 132 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Gm22100-201ENSMUST00000157926 63 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135 ms