Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

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Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm22165-201ENSMUST00000158414 103 ntBASIC-2,2□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC-2,2□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC-2,21□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 Gm44232-201ENSMUST00000204537 225 ntBASIC-2,21□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC-2,21□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 Gm22708-201ENSMUST00000158987 103 ntBASIC-2,21□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 AC156790.3-201ENSMUST00000226200 254 ntBASIC-2,22□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 Mir21c-201ENSMUST00000184910 78 ntBASIC-2,22□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 Gm25158-201ENSMUST00000177681 121 ntBASIC-2,22□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Gm26229-201ENSMUST00000179699 121 ntBASIC-2,22□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Gm27285-201ENSMUST00000183875 127 ntBASIC-2,22□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-2,22□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Mir539-201ENSMUST00000102109 74 ntBASIC-2,23□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Gm22459-201ENSMUST00000082577 108 ntBASIC-2,23□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC-2,23□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC-2,23□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Gm25862-201ENSMUST00000158250 129 ntBASIC-2,23□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC-2,23□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-2,23□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC-2,24□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Gm25995-201ENSMUST00000175396 142 ntBASIC-2,24□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC-2,24□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Gm22313-201ENSMUST00000158008 129 ntBASIC-2,24□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Gm27937-201ENSMUST00000183605 88 ntBASIC-2,24□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Gm23556-201ENSMUST00000157821 92 ntBASIC-2,25□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Gm22573-201ENSMUST00000082982 102 ntBASIC-2,25□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Gm25618-201ENSMUST00000179484 107 ntBASIC-2,25□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Mir7673-201ENSMUST00000184567 64 ntBASIC-2,25□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC-2,25□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC-2,26□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC-2,26□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC-2,26□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Gm23344-201ENSMUST00000083818 68 ntBASIC-2,26□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Mir764-201ENSMUST00000103259 108 ntBASIC-2,26□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC-2,26□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC-2,26□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC-2,26□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC-2,26□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC-2,27□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC-2,27□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Gm23240-201ENSMUST00000083009 121 ntBASIC-2,27□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Gm24683-201ENSMUST00000104840 88 ntBASIC-2,27□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC-2,27□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Gm23428-201ENSMUST00000122488 102 ntBASIC-2,27□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Gm23148-201ENSMUST00000180367 107 ntBASIC-2,27□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC-2,27□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC-2,27□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 AC157602.1-201ENSMUST00000197446 105 ntBASIC-2,28□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Gm24097-201ENSMUST00000178720 107 ntBASIC-2,28□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC-2,28□□□□□ -2,77
ApobE9Q414 Gm44563-201ENSMUST00000207958 178 ntBASIC-2,29□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC-2,29□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC-2,29□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC-2,29□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC-2,3□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Gm9805-201ENSMUST00000055305 171 ntAPPRIS P1 BASIC-2,3□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC-2,3□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC-2,3□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Gm23017-201ENSMUST00000177583 72 ntBASIC-2,3□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Mir741-201ENSMUST00000103931 71 ntBASIC-2,31□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC-2,31□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Gm21961-201ENSMUST00000110100 114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-2,31□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Gm44923-201ENSMUST00000206673 85 ntBASIC-2,31□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC-2,31□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Gm38213-201ENSMUST00000193203 173 ntBASIC-2,31□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Gm44142-201ENSMUST00000203358 311 ntBASIC-2,31□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Mir29a-201ENSMUST00000083676 88 ntBASIC-2,31□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC-2,31□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Gm24773-201ENSMUST00000158513 99 ntBASIC-2,31□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Gm37646-201ENSMUST00000191756 111 ntBASIC-2,31□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC-2,31□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Gm44858-201ENSMUST00000207360 154 ntBASIC-2,31□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC-2,32□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC-2,32□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Gm22336-201ENSMUST00000157719 107 ntBASIC-2,32□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Mir802-201ENSMUST00000103258 97 ntBASIC-2,32□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC-2,32□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Gm25229-201ENSMUST00000178587 79 ntBASIC-2,32□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC-2,33□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC-2,33□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC-2,33□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC-2,33□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC-2,33□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Gm25812-201ENSMUST00000082751 103 ntBASIC-2,33□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC-2,33□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Gm22296-201ENSMUST00000083310 103 ntBASIC-2,33□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Gm24016-201ENSMUST00000157726 68 ntBASIC-2,34□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Mir5619-201ENSMUST00000176065 61 ntBASIC-2,34□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 n-R5s218-201ENSMUST00000122583 109 ntBASIC-2,34□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Gm23587-201ENSMUST00000157658 84 ntBASIC-2,34□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC-2,34□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC-2,34□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Gm24697-201ENSMUST00000083881 107 ntBASIC-2,34□□□□□ -2,78
ApobE9Q414 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC-2,35□□□□□ -2,79
ApobE9Q414 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC-2,35□□□□□ -2,79
ApobE9Q414 Gm25749-201ENSMUST00000175485 111 ntBASIC-2,35□□□□□ -2,79
ApobE9Q414 Gm22286-201ENSMUST00000179708 107 ntBASIC-2,36□□□□□ -2,79
ApobE9Q414 AC145736.2-201ENSMUST00000216305 365 ntBASIC-2,36□□□□□ -2,79
ApobE9Q414 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC-2,36□□□□□ -2,79
ApobE9Q414 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC-2,36□□□□□ -2,79
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