Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1
Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mouse
Protein |
RNA |
Prediction (catRAPID) |
Interaction (Experimental data) |
Gene |
UniProt Accession |
Transcript Symbol |
Ensembl Transcript ID |
Length |
Transcript Status |
Prediction Score |
Prediction z-Score |
p-Value |
Fold Change |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm19248-201 | ENSMUST00000209404 | 110 nt | BASIC | -1,28 | □□□□□ -2,61 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23423-201 | ENSMUST00000082782 | 106 nt | BASIC | -1,28 | □□□□□ -2,61 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23904-201 | ENSMUST00000157567 | 124 nt | BASIC | -1,29 | □□□□□ -2,62 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm22242-201 | ENSMUST00000175224 | 118 nt | BASIC | -1,29 | □□□□□ -2,62 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm26438-201 | ENSMUST00000082593 | 107 nt | BASIC | -1,29 | □□□□□ -2,62 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23772-201 | ENSMUST00000104433 | 102 nt | BASIC | -1,3 | □□□□□ -2,62 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23613-201 | ENSMUST00000082596 | 87 nt | BASIC | -1,3 | □□□□□ -2,62 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm37796-201 | ENSMUST00000195327 | 134 nt | BASIC | -1,31 | □□□□□ -2,62 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Olfr1108-ps1-201 | ENSMUST00000216930 | 121 nt | BASIC | -1,31 | □□□□□ -2,62 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Snord61-201 | ENSMUST00000083176 | 71 nt | BASIC | -1,31 | □□□□□ -2,62 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Tcrg-V4-201 | ENSMUST00000103554 | 426 nt | APPRIS P1 BASIC | -1,32 | □□□□□ -2,62 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm26018-201 | ENSMUST00000104406 | 128 nt | BASIC | -1,32 | □□□□□ -2,62 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23214-201 | ENSMUST00000122716 | 157 nt | BASIC | -1,32 | □□□□□ -2,62 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm28020-201 | ENSMUST00000157739 | 67 nt | BASIC | -1,32 | □□□□□ -2,62 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23892-201 | ENSMUST00000158105 | 130 nt | BASIC | -1,32 | □□□□□ -2,62 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Mir3094-201 | ENSMUST00000175121 | 64 nt | BASIC | -1,32 | □□□□□ -2,62 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23186-201 | ENSMUST00000180078 | 107 nt | BASIC | -1,32 | □□□□□ -2,62 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | mt-Tw-201 | ENSMUST00000082397 | 67 nt | BASIC | -1,32 | □□□□□ -2,62 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Mir669o-201 | ENSMUST00000103898 | 96 nt | BASIC | -1,33 | □□□□□ -2,62 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm26043-201 | ENSMUST00000116912 | 91 nt | BASIC | -1,33 | □□□□□ -2,62 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm25184-201 | ENSMUST00000157753 | 163 nt | BASIC | -1,33 | □□□□□ -2,62 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Snord2-201 | ENSMUST00000157899 | 69 nt | BASIC | -1,33 | □□□□□ -2,62 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm22732-201 | ENSMUST00000158093 | 121 nt | BASIC | -1,33 | □□□□□ -2,62 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm43907-201 | ENSMUST00000203128 | 117 nt | BASIC | -1,33 | □□□□□ -2,62 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23812-201 | ENSMUST00000175156 | 84 nt | BASIC | -1,34 | □□□□□ -2,62 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23374-201 | ENSMUST00000175408 | 84 nt | BASIC | -1,34 | □□□□□ -2,62 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23308-201 | ENSMUST00000179475 | 107 nt | BASIC | -1,34 | □□□□□ -2,62 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | AC153646.2-201 | ENSMUST00000220516 | 109 nt | BASIC | -1,34 | □□□□□ -2,62 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm14502-201 | ENSMUST00000118154 | 113 nt | BASIC | -1,35 | □□□□□ -2,63 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm27934-201 | ENSMUST00000158795 | 63 nt | BASIC | -1,35 | □□□□□ -2,63 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Mir6339-201 | ENSMUST00000185120 | 117 nt | BASIC | -1,35 | □□□□□ -2,63 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm28211-201 | ENSMUST00000190920 | 315 nt | BASIC | -1,35 | □□□□□ -2,63 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | 7330423F06Rik-201 | ENSMUST00000197499 | 301 nt | BASIC | -1,35 | □□□□□ -2,63 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | AC124739.2-201 | ENSMUST00000222201 | 109 nt | BASIC | -1,35 | □□□□□ -2,63 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm9805-201 | ENSMUST00000055305 | 171 nt | APPRIS P1 BASIC | -1,35 | □□□□□ -2,63 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Mir466f-1-201 | ENSMUST00000104779 | 94 nt | BASIC | -1,36 | □□□□□ -2,63 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23900-201 | ENSMUST00000157569 | 108 nt | BASIC | -1,36 | □□□□□ -2,63 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm22080-201 | ENSMUST00000157591 | 106 nt | BASIC | -1,36 | □□□□□ -2,63 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23080-201 | ENSMUST00000157846 | 103 nt | BASIC | -1,36 | □□□□□ -2,63 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23451-201 | ENSMUST00000083328 | 122 nt | BASIC | -1,36 | □□□□□ -2,63 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm25275-201 | ENSMUST00000104297 | 129 nt | BASIC | -1,37 | □□□□□ -2,63 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm14883-201 | ENSMUST00000120179 | 157 nt | BASIC | -1,37 | □□□□□ -2,63 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Ighv15-1-201 | ENSMUST00000194450 | 276 nt | BASIC | -1,37 | □□□□□ -2,63 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm25622-201 | ENSMUST00000157217 | 104 nt | BASIC | -1,38 | □□□□□ -2,63 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm24729-201 | ENSMUST00000158225 | 137 nt | BASIC | -1,38 | □□□□□ -2,63 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm24971-201 | ENSMUST00000175581 | 110 nt | BASIC | -1,38 | □□□□□ -2,63 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Snord19-201 | ENSMUST00000104609 | 76 nt | BASIC | -1,39 | □□□□□ -2,63 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23166-201 | ENSMUST00000157164 | 101 nt | BASIC | -1,39 | □□□□□ -2,63 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Mir7057-201 | ENSMUST00000184685 | 58 nt | BASIC | -1,39 | □□□□□ -2,63 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Sult1c2-ps2-201 | ENSMUST00000196414 | 276 nt | BASIC | -1,39 | □□□□□ -2,63 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | AC168880.2-201 | ENSMUST00000224488 | 201 nt | BASIC | -1,39 | □□□□□ -2,63 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Mir717-201 | ENSMUST00000102259 | 109 nt | BASIC | -1,4 | □□□□□ -2,63 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Mir297b-201 | ENSMUST00000102268 | 109 nt | BASIC | -1,4 | □□□□□ -2,63 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Mir881-201 | ENSMUST00000104844 | 78 nt | BASIC | -1,4 | □□□□□ -2,63 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm24141-201 | ENSMUST00000122776 | 115 nt | BASIC | -1,4 | □□□□□ -2,63 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | n-R5s153-201 | ENSMUST00000083451 | 116 nt | BASIC | -1,4 | □□□□□ -2,63 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23581-201 | ENSMUST00000158531 | 63 nt | BASIC | -1,4 | □□□□□ -2,63 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Mirlet7a-2-201 | ENSMUST00000175029 | 96 nt | BASIC | -1,4 | □□□□□ -2,63 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm25248-201 | ENSMUST00000175473 | 98 nt | BASIC | -1,4 | □□□□□ -2,63 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm6897-201 | ENSMUST00000117714 | 138 nt | BASIC | -1,41 | □□□□□ -2,64 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm14758-201 | ENSMUST00000119104 | 138 nt | BASIC | -1,41 | □□□□□ -2,64 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm22216-201 | ENSMUST00000157557 | 114 nt | BASIC | -1,41 | □□□□□ -2,64 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm25656-201 | ENSMUST00000158466 | 66 nt | BASIC | -1,41 | □□□□□ -2,64 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm26456-201 | ENSMUST00000082831 | 111 nt | BASIC | -1,41 | □□□□□ -2,64 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm22479-201 | ENSMUST00000122566 | 81 nt | BASIC | -1,42 | □□□□□ -2,64 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm43505-201 | ENSMUST00000200579 | 139 nt | BASIC | -1,42 | □□□□□ -2,64 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm45429-201 | ENSMUST00000209527 | 172 nt | BASIC | -1,42 | □□□□□ -2,64 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23726-201 | ENSMUST00000178937 | 67 nt | BASIC | -1,43 | □□□□□ -2,64 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm22203-201 | ENSMUST00000158605 | 58 nt | BASIC | -1,44 | □□□□□ -2,64 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Mir541-201 | ENSMUST00000102097 | 90 nt | BASIC | -1,45 | □□□□□ -2,64 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Mir764-201 | ENSMUST00000103259 | 108 nt | BASIC | -1,45 | □□□□□ -2,64 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Mir466p-201 | ENSMUST00000103925 | 89 nt | BASIC | -1,45 | □□□□□ -2,64 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23841-201 | ENSMUST00000116951 | 114 nt | BASIC | -1,45 | □□□□□ -2,64 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm45859-201 | ENSMUST00000212794 | 214 nt | BASIC | -1,45 | □□□□□ -2,64 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm24121-201 | ENSMUST00000102029 | 106 nt | BASIC | -1,46 | □□□□□ -2,64 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm42773-201 | ENSMUST00000196962 | 148 nt | BASIC | -1,46 | □□□□□ -2,64 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | AC165157.3-201 | ENSMUST00000220815 | 103 nt | BASIC | -1,46 | □□□□□ -2,64 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm12086-201 | ENSMUST00000120863 | 228 nt | BASIC | -1,47 | □□□□□ -2,65 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm25225-201 | ENSMUST00000158197 | 102 nt | BASIC | -1,47 | □□□□□ -2,65 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm26159-201 | ENSMUST00000158968 | 104 nt | BASIC | -1,47 | □□□□□ -2,65 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm22638-201 | ENSMUST00000179674 | 107 nt | BASIC | -1,47 | □□□□□ -2,65 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm27792-201 | ENSMUST00000184031 | 115 nt | BASIC | -1,47 | □□□□□ -2,65 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm22145-201 | ENSMUST00000157396 | 148 nt | BASIC | -1,48 | □□□□□ -2,65 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23291-201 | ENSMUST00000175611 | 78 nt | BASIC | -1,48 | □□□□□ -2,65 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | mt-Ta-201 | ENSMUST00000082398 | 69 nt | BASIC | -1,48 | □□□□□ -2,65 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm25899-201 | ENSMUST00000082672 | 141 nt | BASIC | -1,48 | □□□□□ -2,65 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm26062-201 | ENSMUST00000083379 | 107 nt | BASIC | -1,48 | □□□□□ -2,65 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm24765-201 | ENSMUST00000083691 | 103 nt | BASIC | -1,48 | □□□□□ -2,65 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm24580-201 | ENSMUST00000103965 | 131 nt | BASIC | -1,49 | □□□□□ -2,65 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm25712-201 | ENSMUST00000158634 | 93 nt | BASIC | -1,49 | □□□□□ -2,65 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23630-201 | ENSMUST00000175292 | 104 nt | BASIC | -1,49 | □□□□□ -2,65 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm27476-201 | ENSMUST00000183366 | 104 nt | BASIC | -1,49 | □□□□□ -2,65 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Mir6957-201 | ENSMUST00000183708 | 64 nt | BASIC | -1,49 | □□□□□ -2,65 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm22744-201 | ENSMUST00000083444 | 65 nt | BASIC | -1,49 | □□□□□ -2,65 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm22595-201 | ENSMUST00000104250 | 130 nt | BASIC | -1,5 | □□□□□ -2,65 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm14533-201 | ENSMUST00000117088 | 93 nt | BASIC | -1,5 | □□□□□ -2,65 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm25749-201 | ENSMUST00000175485 | 111 nt | BASIC | -1,5 | □□□□□ -2,65 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm24522-201 | ENSMUST00000083964 | 108 nt | BASIC | -1,5 | □□□□□ -2,65 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Mup-ps5-201 | ENSMUST00000118667 | 99 nt | BASIC | -1,51 | □□□□□ -2,65 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm24064-201 | ENSMUST00000157486 | 106 nt | BASIC | -1,51 | □□□□□ -2,65 | | |
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