Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 mt-Ta-201ENSMUST00000082398 69 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm25654-201ENSMUST00000158467 88 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm29535-201ENSMUST00000185723 109 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm28143-201ENSMUST00000191082 109 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Mir1949-202ENSMUST00000199259 70 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm24522-201ENSMUST00000083964 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm24129-201ENSMUST00000158537 97 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm25952-201ENSMUST00000175329 74 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm25032-201ENSMUST00000175411 84 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Mir6375-201ENSMUST00000197176 95 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm22981-201ENSMUST00000082611 75 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm24233-201ENSMUST00000104317 122 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm25184-201ENSMUST00000157753 163 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm25329-201ENSMUST00000158041 126 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm27285-201ENSMUST00000183875 127 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Mir8107-201ENSMUST00000184024 117 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm25703-201ENSMUST00000083123 151 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Mir302d-201ENSMUST00000083513 66 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm25006-201ENSMUST00000083813 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm43381-201ENSMUST00000198553 165 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 CT009723.2-201ENSMUST00000215702 124 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm22607-201ENSMUST00000158291 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Mir3470a-201ENSMUST00000175223 77 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Snora75-201ENSMUST00000082903 133 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm24796-201ENSMUST00000104007 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm25408-201ENSMUST00000104104 133 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm23320-201ENSMUST00000104462 127 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm25309-201ENSMUST00000116728 126 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm44328-201ENSMUST00000199331 75 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm26202-201ENSMUST00000082910 65 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm24232-201ENSMUST00000104314 132 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm22327-201ENSMUST00000158899 108 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Mir3473d-201ENSMUST00000175346 81 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Mir3105-201ENSMUST00000175480 85 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm27297-201ENSMUST00000183395 105 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm27803-201ENSMUST00000183763 119 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm27465-201ENSMUST00000184290 91 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm37545-201ENSMUST00000186512 148 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm23977-201ENSMUST00000177871 74 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Snord91a-201ENSMUST00000104305 93 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm25388-201ENSMUST00000157339 151 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm25307-201ENSMUST00000158885 106 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm17020-201ENSMUST00000172274 274 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Snord85-201ENSMUST00000083262 73 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm22595-201ENSMUST00000104250 130 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm24197-201ENSMUST00000175085 109 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm42845-201ENSMUST00000197766 105 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm45197-201ENSMUST00000205288 151 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Mir126a-201ENSMUST00000083606 73 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Col5a3Q9JLI2 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Col5a3Q9JLI2 Gm22348-201ENSMUST00000178674 79 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Col5a3Q9JLI2 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Col5a3Q9JLI2 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Col5a3Q9JLI2 Gm13065-201ENSMUST00000119178 141 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Col5a3Q9JLI2 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Col5a3Q9JLI2 Gm22077-201ENSMUST00000157594 93 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Col5a3Q9JLI2 Gm26398-201ENSMUST00000179015 127 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Col5a3Q9JLI2 Mir6964-201ENSMUST00000200252 59 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Col5a3Q9JLI2 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Col5a3Q9JLI2 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
Col5a3Q9JLI2 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Col5a3Q9JLI2 Mir18-201ENSMUST00000083469 96 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Col5a3Q9JLI2 Gm27884-201ENSMUST00000183865 76 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Col5a3Q9JLI2 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Col5a3Q9JLI2 Mir3065-201ENSMUST00000198674 87 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Col5a3Q9JLI2 Gm44327-201ENSMUST00000200068 117 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Col5a3Q9JLI2 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Col5a3Q9JLI2 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Col5a3Q9JLI2 Gm12086-201ENSMUST00000120863 228 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Col5a3Q9JLI2 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Col5a3Q9JLI2 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.4 ms