Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Irx5Q9JKQ4 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Irx5Q9JKQ4 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Irx5Q9JKQ4 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Irx5Q9JKQ4 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Gm24009-201ENSMUST00000157734 93 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Gm25641-201ENSMUST00000175135 108 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Gm45038-201ENSMUST00000207537 3838 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Gm23347-201ENSMUST00000083823 82 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Gm27977-201ENSMUST00000185159 111 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Gm24259-201ENSMUST00000083740 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Gm22087-201ENSMUST00000158339 88 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Mir8096-201ENSMUST00000184526 127 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Gm22127-201ENSMUST00000083239 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Gm24710-201ENSMUST00000175235 101 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Gm23291-201ENSMUST00000175611 78 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Gm24135-201ENSMUST00000179085 101 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Gm45655-201ENSMUST00000211625 160 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Irx5Q9JKQ4 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 Gm24723-201ENSMUST00000158233 132 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 Gm25366-201ENSMUST00000158845 124 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 Gm24508-201ENSMUST00000180104 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 Gm22406-201ENSMUST00000174923 93 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 Olfr867-203ENSMUST00000216538 4617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 Gm24983-201ENSMUST00000104457 69 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 Gm22965-201ENSMUST00000157958 101 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 Gm25222-201ENSMUST00000158199 126 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 Gm25010-201ENSMUST00000158403 65 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 Mir376b-201ENSMUST00000195930 82 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 Gm26202-201ENSMUST00000082910 65 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Irx5Q9JKQ4 Gm23500-201ENSMUST00000157735 98 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Irx5Q9JKQ4 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Irx5Q9JKQ4 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Irx5Q9JKQ4 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Irx5Q9JKQ4 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Irx5Q9JKQ4 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Irx5Q9JKQ4 Traj53-201ENSMUST00000103690 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Irx5Q9JKQ4 Gm25759-201ENSMUST00000103988 129 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Irx5Q9JKQ4 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Irx5Q9JKQ4 Gm22593-201ENSMUST00000104245 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Irx5Q9JKQ4 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Irx5Q9JKQ4 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Irx5Q9JKQ4 Gm24129-201ENSMUST00000158537 97 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Irx5Q9JKQ4 Gm25974-201ENSMUST00000158701 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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