Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 AC122327.1-201ENSMUST00000220778 108 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 Gm26062-201ENSMUST00000083379 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 Gm14884-201ENSMUST00000120456 196 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 Mir6237-201ENSMUST00000183808 91 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 mt-Tn-201ENSMUST00000082399 71 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 Gm22679-201ENSMUST00000116975 100 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 Gm22827-201ENSMUST00000083766 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 Gm22761-201ENSMUST00000102278 96 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 Gm25112-201ENSMUST00000122680 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 Gm25899-201ENSMUST00000082672 141 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 Gm22785-201ENSMUST00000104087 132 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 Gm23369-201ENSMUST00000175406 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 Gm22673-201ENSMUST00000104415 131 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 Gm26425-201ENSMUST00000122529 82 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Mrpl49Q9CQ40 Gm22033-201ENSMUST00000116947 90 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm25014-201ENSMUST00000158401 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm12469-201ENSMUST00000117623 207 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm25635-201ENSMUST00000082675 131 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm24399-201ENSMUST00000157869 74 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm44490-201ENSMUST00000198566 127 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm45197-201ENSMUST00000205288 151 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Mir92-2-201ENSMUST00000083679 91 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm11694-201ENSMUST00000118637 159 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm23900-201ENSMUST00000157569 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm23410-201ENSMUST00000179967 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm22505-201ENSMUST00000082956 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm26133-201ENSMUST00000157363 100 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Mrpl49Q9CQ40 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.17
Mrpl49Q9CQ40 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Mrpl49Q9CQ40 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Mrpl49Q9CQ40 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Mrpl49Q9CQ40 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Mrpl49Q9CQ40 Mir6962-201ENSMUST00000199512 63 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Mrpl49Q9CQ40 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Mrpl49Q9CQ40 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Mrpl49Q9CQ40 Gm37824-201ENSMUST00000193430 3236 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Mrpl49Q9CQ40 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Mrpl49Q9CQ40 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Mrpl49Q9CQ40 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 204.7 ms