Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm25678-201ENSMUST00000174984 73 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Snord80-201ENSMUST00000083801 81 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm22503-201ENSMUST00000158983 115 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm25899-201ENSMUST00000082672 141 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm24650-201ENSMUST00000157105 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm26029-201ENSMUST00000158659 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Olfr307-203ENSMUST00000217494 4515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Zfp813-ps-201ENSMUST00000186652 2506 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm23601-201ENSMUST00000157259 131 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm22089-201ENSMUST00000158336 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm26398-201ENSMUST00000179015 127 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm22770-201ENSMUST00000158368 67 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm25635-201ENSMUST00000082675 131 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm22753-201ENSMUST00000083657 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm23244-201ENSMUST00000083375 92 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm12469-201ENSMUST00000117623 207 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm16265-201ENSMUST00000134558 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm22706-201ENSMUST00000157907 112 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Mir6237-201ENSMUST00000183808 91 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm45197-201ENSMUST00000205288 151 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 AC166341.8-201ENSMUST00000221267 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm24099-201ENSMUST00000083384 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm11694-201ENSMUST00000118637 159 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm27974-201ENSMUST00000183415 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Pggt1bQ8BUY9 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Pggt1bQ8BUY9 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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