Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

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Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC-2,05□□□□□ -2,74
ApobE9Q414 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-2,05□□□□□ -2,74
ApobE9Q414 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC-2,06□□□□□ -2,74
ApobE9Q414 Gm25010-201ENSMUST00000158403 65 ntBASIC-2,06□□□□□ -2,74
ApobE9Q414 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC-2,06□□□□□ -2,74
ApobE9Q414 Gm23607-201ENSMUST00000104550 126 ntBASIC-2,06□□□□□ -2,74
ApobE9Q414 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC-2,07□□□□□ -2,74
ApobE9Q414 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC-2,07□□□□□ -2,74
ApobE9Q414 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC-2,07□□□□□ -2,74
ApobE9Q414 Mirlet7a-1-201ENSMUST00000083487 94 ntBASIC-2,07□□□□□ -2,74
ApobE9Q414 Gm12924-201ENSMUST00000121747 318 ntBASIC-2,07□□□□□ -2,74
ApobE9Q414 Mir509-201ENSMUST00000196089 75 ntBASIC-2,07□□□□□ -2,74
ApobE9Q414 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC-2,07□□□□□ -2,74
ApobE9Q414 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC-2,07□□□□□ -2,74
ApobE9Q414 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-2,07□□□□□ -2,74
ApobE9Q414 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC-2,08□□□□□ -2,74
ApobE9Q414 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC-2,08□□□□□ -2,74
ApobE9Q414 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC-2,08□□□□□ -2,74
ApobE9Q414 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC-2,08□□□□□ -2,74
ApobE9Q414 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC-2,09□□□□□ -2,74
ApobE9Q414 Mir669g-201ENSMUST00000116809 123 ntBASIC-2,09□□□□□ -2,74
ApobE9Q414 Gm24673-201ENSMUST00000116948 124 ntBASIC-2,09□□□□□ -2,74
ApobE9Q414 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC-2,09□□□□□ -2,74
ApobE9Q414 Gm23108-201ENSMUST00000178295 124 ntBASIC-2,09□□□□□ -2,74
ApobE9Q414 Gm23306-201ENSMUST00000179058 105 ntBASIC-2,09□□□□□ -2,74
ApobE9Q414 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC-2,09□□□□□ -2,74
ApobE9Q414 9230110F11Rik-202ENSMUST00000212907 191 ntTSL 5 BASIC-2,09□□□□□ -2,74
ApobE9Q414 Gm26228-201ENSMUST00000082512 107 ntBASIC-2,09□□□□□ -2,74
ApobE9Q414 Gm23173-201ENSMUST00000157161 160 ntBASIC-2,09□□□□□ -2,74
ApobE9Q414 Gm25440-201ENSMUST00000158279 154 ntBASIC-2,09□□□□□ -2,74
ApobE9Q414 Gm23143-201ENSMUST00000180137 116 ntBASIC-2,1□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Gm23448-201ENSMUST00000083151 104 ntBASIC-2,1□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Mir421-201ENSMUST00000083575 76 ntBASIC-2,1□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC-2,1□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Gm23955-201ENSMUST00000157214 100 ntBASIC-2,1□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Gm27964-201ENSMUST00000185195 62 ntBASIC-2,1□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC-2,11□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC-2,11□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC-2,11□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC-2,11□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC-2,12□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC-2,12□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC-2,12□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC-2,12□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Gm22071-201ENSMUST00000116857 83 ntBASIC-2,12□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC-2,12□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Gm26231-201ENSMUST00000175218 67 ntBASIC-2,12□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Mir6411-201ENSMUST00000183556 108 ntBASIC-2,13□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Gm23730-201ENSMUST00000083236 107 ntBASIC-2,13□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC-2,13□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Mir367-201ENSMUST00000083479 75 ntBASIC-2,13□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Mir466b-3-201ENSMUST00000103806 81 ntBASIC-2,14□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Gm27699-201ENSMUST00000183553 180 ntBASIC-2,14□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC-2,14□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC-2,14□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Gm23817-201ENSMUST00000158449 104 ntBASIC-2,14□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC-2,14□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC-2,14□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC-2,14□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Gm27446-201ENSMUST00000183963 89 ntBASIC-2,14□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC-2,14□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Gm27263-201ENSMUST00000184760 76 ntBASIC-2,14□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Igkv13-56-1-201ENSMUST00000198481 209 ntBASIC-2,15□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC-2,15□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Gm24983-201ENSMUST00000104457 69 ntBASIC-2,15□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC-2,15□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Snora2b-201ENSMUST00000084005 137 ntBASIC-2,15□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Gm24686-201ENSMUST00000157755 93 ntBASIC-2,16□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC-2,16□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC-2,16□□□□□ -2,75
ApobE9Q414 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC-2,16□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC-2,16□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 Gm25899-201ENSMUST00000082672 141 ntBASIC-2,16□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 Gm24631-201ENSMUST00000122765 81 ntBASIC-2,16□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC-2,16□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 Gm22828-201ENSMUST00000083768 107 ntBASIC-2,17□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC-2,17□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 Gm6897-201ENSMUST00000117714 138 ntBASIC-2,17□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 Gm14758-201ENSMUST00000119104 138 ntBASIC-2,17□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 Gm22451-201ENSMUST00000122803 151 ntBASIC-2,17□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 Mir192-201ENSMUST00000083589 89 ntBASIC-2,17□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC-2,17□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC-2,17□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC-2,18□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 Mir190b-201ENSMUST00000104803 80 ntBASIC-2,18□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC-2,18□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-2,18□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 Gm23303-201ENSMUST00000082714 152 ntBASIC-2,18□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC-2,19□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 AC165157.3-201ENSMUST00000220815 103 ntBASIC-2,19□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 Gm24070-201ENSMUST00000104519 130 ntBASIC-2,19□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 Mir3071-201ENSMUST00000093621 80 ntBASIC-2,19□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 Gm23725-201ENSMUST00000177876 107 ntBASIC-2,2□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC-2,2□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 Mir6395-201ENSMUST00000183885 91 ntBASIC-2,2□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 Mir154-201ENSMUST00000083514 66 ntBASIC-2,2□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 Gm44339-201ENSMUST00000200598 84 ntBASIC-2,2□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC-2,2□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC-2,2□□□□□ -2,76
ApobE9Q414 Gm24854-201ENSMUST00000158025 98 ntBASIC-2,2□□□□□ -2,76
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