Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm29047-201ENSMUST00000189816 108 ntBASIC-0,03□□□□□ -2,41
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25006-201ENSMUST00000083813 107 ntBASIC-0,03□□□□□ -2,41
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC-0,04□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23661-201ENSMUST00000122630 87 ntBASIC-0,04□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC-0,04□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm27694-201ENSMUST00000184740 86 ntBASIC-0,04□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm42845-201ENSMUST00000197766 105 ntBASIC-0,04□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm44327-201ENSMUST00000200068 117 ntBASIC-0,04□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm44803-201ENSMUST00000204384 156 ntBASIC-0,04□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm45197-201ENSMUST00000205288 151 ntBASIC-0,04□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22981-201ENSMUST00000082611 75 ntBASIC-0,04□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC-0,05□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir216b-201ENSMUST00000102363 86 ntBASIC-0,05□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC-0,05□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC-0,05□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Snord95-201ENSMUST00000082846 68 ntBASIC-0,05□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC-0,05□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC-0,06□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm11694-201ENSMUST00000118637 159 ntBASIC-0,06□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC-0,06□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir3473d-201ENSMUST00000175346 81 ntBASIC-0,06□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm38208-201ENSMUST00000192476 114 ntBASIC-0,06□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm44345-201ENSMUST00000199560 135 ntBASIC-0,06□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0,06□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC-0,06□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23708-201ENSMUST00000104367 123 ntBASIC-0,07□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC-0,07□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25787-201ENSMUST00000104709 92 ntBASIC-0,07□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24009-201ENSMUST00000157734 93 ntBASIC-0,07□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC-0,07□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm27297-201ENSMUST00000183395 105 ntBASIC-0,07□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC-0,07□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC-0,07□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm6358-201ENSMUST00000089101 156 ntAPPRIS ALT2 BASIC-0,07□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23947-201ENSMUST00000093636 107 ntBASIC-0,07□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25309-201ENSMUST00000116728 126 ntBASIC-0,08□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC-0,08□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Traj61-201ENSMUST00000165025 72 ntBASIC-0,08□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm37545-201ENSMUST00000186512 148 ntBASIC-0,08□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir3967-201ENSMUST00000198710 68 ntBASIC-0,08□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm43927-201ENSMUST00000204599 117 ntBASIC-0,08□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Snord85-201ENSMUST00000083262 73 ntBASIC-0,08□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm26011-201ENSMUST00000104410 104 ntBASIC-0,09□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25056-201ENSMUST00000157372 62 ntBASIC-0,09□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC-0,09□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24073-201ENSMUST00000158177 106 ntBASIC-0,09□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23337-201ENSMUST00000158959 118 ntBASIC-0,09□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0,09□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25247-201ENSMUST00000175475 90 ntBASIC-0,09□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC-0,09□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24457-201ENSMUST00000083196 105 ntBASIC-0,09□□□□□ -2,42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23531-201ENSMUST00000104567 68 ntBASIC-0,1□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC-0,1□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22788-201ENSMUST00000157876 61 ntBASIC-0,1□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC-0,1□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm37746-201ENSMUST00000193249 198 ntBASIC-0,1□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm45617-201ENSMUST00000211132 209 ntBASIC-0,1□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC-0,11□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22077-201ENSMUST00000157594 93 ntBASIC-0,11□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC-0,11□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC-0,11□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC124687.1-201ENSMUST00000221868 189 ntBASIC-0,11□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 mt-Tc-201ENSMUST00000082400 66 ntBASIC-0,11□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25791-201ENSMUST00000083292 137 ntBASIC-0,11□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 n-R5s12-201ENSMUST00000083785 119 ntBASIC-0,11□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir764-201ENSMUST00000103259 108 ntBASIC-0,12□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC-0,12□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC-0,12□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24246-201ENSMUST00000157315 132 ntBASIC-0,12□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC-0,12□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24903-201ENSMUST00000158131 126 ntBASIC-0,12□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25375-201ENSMUST00000158157 135 ntBASIC-0,12□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22088-201ENSMUST00000158341 117 ntBASIC-0,12□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24884-201ENSMUST00000158784 119 ntBASIC-0,12□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22327-201ENSMUST00000158899 108 ntBASIC-0,12□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23504-201ENSMUST00000158988 95 ntBASIC-0,12□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir3089-201ENSMUST00000175350 84 ntBASIC-0,12□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir21c-201ENSMUST00000184910 78 ntBASIC-0,12□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24461-201ENSMUST00000082735 103 ntBASIC-0,12□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC-0,13□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC-0,13□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm12013-201ENSMUST00000121971 155 ntBASIC-0,13□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25161-201ENSMUST00000158913 132 ntBASIC-0,13□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm44328-201ENSMUST00000199331 75 ntBASIC-0,13□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm45374-201ENSMUST00000211388 136 ntBASIC-0,13□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC-0,13□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24796-201ENSMUST00000104007 107 ntBASIC-0,14□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC-0,14□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23654-201ENSMUST00000116758 126 ntBASIC-0,14□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC-0,14□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23260-201ENSMUST00000158317 172 ntBASIC-0,14□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24218-201ENSMUST00000180163 105 ntBASIC-0,14□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25899-201ENSMUST00000082672 141 ntBASIC-0,14□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC-0,14□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC-0,15□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24718-201ENSMUST00000157521 136 ntBASIC-0,15□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22340-201ENSMUST00000157717 114 ntBASIC-0,15□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23994-201ENSMUST00000158059 88 ntBASIC-0,15□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22621-201ENSMUST00000179678 74 ntBASIC-0,15□□□□□ -2,43
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir3065-201ENSMUST00000198674 87 ntBASIC-0,15□□□□□ -2,43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms