Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm22672-201ENSMUST00000104414 134 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm25663-201ENSMUST00000157698 135 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm20118-201ENSMUST00000187207 162 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Mir764-201ENSMUST00000103259 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Gm26425-201ENSMUST00000122529 82 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Mir5619-201ENSMUST00000176065 61 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Gm24801-201ENSMUST00000178503 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Gm25449-201ENSMUST00000179389 79 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Gm22071-201ENSMUST00000116857 83 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Gm23369-201ENSMUST00000175406 105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Gm26398-201ENSMUST00000179015 127 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Mir6237-201ENSMUST00000183808 91 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 mt-Tc-201ENSMUST00000082400 66 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rabgef1Q9JM13 Gm23766-201ENSMUST00000103894 80 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rabgef1Q9JM13 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rabgef1Q9JM13 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Rabgef1Q9JM13 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Rabgef1Q9JM13 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Rabgef1Q9JM13 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Rabgef1Q9JM13 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Rabgef1Q9JM13 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Rabgef1Q9JM13 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Rabgef1Q9JM13 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Rabgef1Q9JM13 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Rabgef1Q9JM13 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Rabgef1Q9JM13 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Rabgef1Q9JM13 Gm25899-201ENSMUST00000082672 141 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Rabgef1Q9JM13 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rabgef1Q9JM13 mt-Tn-201ENSMUST00000082399 71 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rabgef1Q9JM13 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rabgef1Q9JM13 Gm23344-201ENSMUST00000083818 68 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rabgef1Q9JM13 Mir466l-201ENSMUST00000104866 121 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rabgef1Q9JM13 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rabgef1Q9JM13 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rabgef1Q9JM13 Gm22983-201ENSMUST00000158308 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rabgef1Q9JM13 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rabgef1Q9JM13 Gm25618-201ENSMUST00000179484 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rabgef1Q9JM13 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rabgef1Q9JM13 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rabgef1Q9JM13 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rabgef1Q9JM13 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rabgef1Q9JM13 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rabgef1Q9JM13 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rabgef1Q9JM13 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rabgef1Q9JM13 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rabgef1Q9JM13 C920009B18Rik-204ENSMUST00000181733 123 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Gm22785-201ENSMUST00000104087 132 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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