Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Mir3108-201ENSMUST00000175500 79 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm45541-201ENSMUST00000210443 54 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm44455-201ENSMUST00000200061 82 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Mir672-201ENSMUST00000102331 100 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Mir669g-201ENSMUST00000116809 123 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm25390-201ENSMUST00000157341 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm27446-201ENSMUST00000183963 89 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Mir214-201ENSMUST00000083582 110 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm22520-201ENSMUST00000158269 129 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm44457-201ENSMUST00000198109 76 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Mirlet7g-201ENSMUST00000083506 88 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.1□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm12469-201ENSMUST00000117623 207 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm38208-201ENSMUST00000192476 114 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm24321-201ENSMUST00000175348 80 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Mir7229-201ENSMUST00000197062 53 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 AC153646.2-201ENSMUST00000220516 109 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm25141-201ENSMUST00000083177 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm25991-201ENSMUST00000102439 99 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm25985-201ENSMUST00000122677 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm27610-201ENSMUST00000184026 74 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Traj30-201ENSMUST00000103711 59 ntAPPRIS P1 BASIC0.07□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Mir466f-1-201ENSMUST00000104779 94 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm25693-201ENSMUST00000175443 85 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm22303-201ENSMUST00000082686 122 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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Col5a3Q9JLI2 Gm23772-201ENSMUST00000104433 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm45374-201ENSMUST00000211388 136 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm22368-201ENSMUST00000102416 109 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm22541-201ENSMUST00000158165 127 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Mir376b-201ENSMUST00000195930 82 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm44469-201ENSMUST00000198558 79 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Mir201-201ENSMUST00000083470 66 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm24833-201ENSMUST00000116775 120 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm23821-201ENSMUST00000158738 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Gm28001-201ENSMUST00000183561 117 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Col5a3Q9JLI2 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
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