Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

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Length 382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 CT030166.3-201ENSMUST00000223203 193 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Lmx1aQ9JKU8 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Lmx1aQ9JKU8 Gm25309-201ENSMUST00000116728 126 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Lmx1aQ9JKU8 Gm24129-201ENSMUST00000158537 97 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Lmx1aQ9JKU8 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Lmx1aQ9JKU8 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Lmx1aQ9JKU8 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Lmx1aQ9JKU8 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Lmx1aQ9JKU8 Gm22368-201ENSMUST00000102416 109 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Lmx1aQ9JKU8 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Lmx1aQ9JKU8 Gm12469-201ENSMUST00000117623 207 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Lmx1aQ9JKU8 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Lmx1aQ9JKU8 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Lmx1aQ9JKU8 Mir6915-201ENSMUST00000198839 69 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Lmx1aQ9JKU8 AC153646.2-201ENSMUST00000220516 109 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Lmx1aQ9JKU8 Gm22303-201ENSMUST00000082686 122 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Lmx1aQ9JKU8 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Lmx1aQ9JKU8 Gm25329-201ENSMUST00000158041 126 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Lmx1aQ9JKU8 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Lmx1aQ9JKU8 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Lmx1aQ9JKU8 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Lmx1aQ9JKU8 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Lmx1aQ9JKU8 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Lmx1aQ9JKU8 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Lmx1aQ9JKU8 Gm24233-201ENSMUST00000104317 122 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Lmx1aQ9JKU8 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Lmx1aQ9JKU8 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Lmx1aQ9JKU8 Mir3473d-201ENSMUST00000175346 81 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Lmx1aQ9JKU8 Gm25693-201ENSMUST00000175443 85 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Lmx1aQ9JKU8 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Lmx1aQ9JKU8 Gm25040-201ENSMUST00000103877 66 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Lmx1aQ9JKU8 Gm13065-201ENSMUST00000119178 141 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Lmx1aQ9JKU8 Mir376b-201ENSMUST00000195930 82 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Lmx1aQ9JKU8 Gm43381-201ENSMUST00000198553 165 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Lmx1aQ9JKU8 Gm44328-201ENSMUST00000199331 75 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Lmx1aQ9JKU8 Gm25006-201ENSMUST00000083813 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Lmx1aQ9JKU8 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Lmx1aQ9JKU8 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Lmx1aQ9JKU8 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Lmx1aQ9JKU8 Gm27446-201ENSMUST00000183963 89 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Lmx1aQ9JKU8 Mir191-201ENSMUST00000196210 74 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Lmx1aQ9JKU8 Gm26202-201ENSMUST00000082910 65 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Lmx1aQ9JKU8 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Lmx1aQ9JKU8 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Lmx1aQ9JKU8 Gm22327-201ENSMUST00000158899 108 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Lmx1aQ9JKU8 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Lmx1aQ9JKU8 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Lmx1aQ9JKU8 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Lmx1aQ9JKU8 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Lmx1aQ9JKU8 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Lmx1aQ9JKU8 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Lmx1aQ9JKU8 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
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Lmx1aQ9JKU8 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
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Lmx1aQ9JKU8 CT009723.2-201ENSMUST00000215702 124 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
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Lmx1aQ9JKU8 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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Lmx1aQ9JKU8 Gm23320-201ENSMUST00000104462 127 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Lmx1aQ9JKU8 Gm25184-201ENSMUST00000157753 163 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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Lmx1aQ9JKU8 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Lmx1aQ9JKU8 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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Lmx1aQ9JKU8 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Lmx1aQ9JKU8 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Lmx1aQ9JKU8 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Lmx1aQ9JKU8 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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Lmx1aQ9JKU8 Gm25974-201ENSMUST00000158701 94 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Lmx1aQ9JKU8 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Lmx1aQ9JKU8 Ranbp2-ps1-201ENSMUST00000184001 403 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Lmx1aQ9JKU8 Gm45374-201ENSMUST00000211388 136 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Lmx1aQ9JKU8 mt-Ta-201ENSMUST00000082398 69 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Lmx1aQ9JKU8 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Lmx1aQ9JKU8 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Lmx1aQ9JKU8 Snord85-201ENSMUST00000083262 73 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Lmx1aQ9JKU8 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Lmx1aQ9JKU8 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Lmx1aQ9JKU8 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Lmx1aQ9JKU8 Mir3065-201ENSMUST00000198674 87 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Lmx1aQ9JKU8 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Lmx1aQ9JKU8 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
Lmx1aQ9JKU8 n-R5s42-201ENSMUST00000082697 104 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Lmx1aQ9JKU8 Mir18-201ENSMUST00000083469 96 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Lmx1aQ9JKU8 Gm24796-201ENSMUST00000104007 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Lmx1aQ9JKU8 Gm25985-201ENSMUST00000122677 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
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