Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Chmp3Q9CQ10 Gm24229-201ENSMUST00000158830 118 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Chmp3Q9CQ10 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Chmp3Q9CQ10 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Chmp3Q9CQ10 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Chmp3Q9CQ10 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Chmp3Q9CQ10 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Chmp3Q9CQ10 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Chmp3Q9CQ10 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Chmp3Q9CQ10 Gm23369-201ENSMUST00000175406 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Chmp3Q9CQ10 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Chmp3Q9CQ10 Gm23344-201ENSMUST00000083818 68 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Chmp3Q9CQ10 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Chmp3Q9CQ10 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Chmp3Q9CQ10 mt-Tn-201ENSMUST00000082399 71 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Chmp3Q9CQ10 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Chmp3Q9CQ10 n-R5s63-201ENSMUST00000122756 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Chmp3Q9CQ10 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Chmp3Q9CQ10 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Chmp3Q9CQ10 Gm25635-201ENSMUST00000082675 131 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Chmp3Q9CQ10 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Chmp3Q9CQ10 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Chmp3Q9CQ10 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Chmp3Q9CQ10 Gm25618-201ENSMUST00000179484 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Chmp3Q9CQ10 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Chmp3Q9CQ10 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Chmp3Q9CQ10 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Chmp3Q9CQ10 Gm22071-201ENSMUST00000116857 83 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Chmp3Q9CQ10 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Chmp3Q9CQ10 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Chmp3Q9CQ10 Gm28862-201ENSMUST00000188246 163 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Chmp3Q9CQ10 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Chmp3Q9CQ10 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Chmp3Q9CQ10 Gm24637-201ENSMUST00000158674 85 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Chmp3Q9CQ10 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Chmp3Q9CQ10 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Chmp3Q9CQ10 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Chmp3Q9CQ10 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Chmp3Q9CQ10 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Chmp3Q9CQ10 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Chmp3Q9CQ10 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Chmp3Q9CQ10 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Chmp3Q9CQ10 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Chmp3Q9CQ10 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Chmp3Q9CQ10 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Chmp3Q9CQ10 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Chmp3Q9CQ10 Mir466l-201ENSMUST00000104866 121 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Chmp3Q9CQ10 Gm14884-201ENSMUST00000120456 196 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Chmp3Q9CQ10 Gm22605-201ENSMUST00000158289 108 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Chmp3Q9CQ10 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Chmp3Q9CQ10 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Chmp3Q9CQ10 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Chmp3Q9CQ10 Gm26062-201ENSMUST00000083379 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Chmp3Q9CQ10 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Chmp3Q9CQ10 Gm24399-201ENSMUST00000157869 74 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Chmp3Q9CQ10 Gm20108-201ENSMUST00000219977 153 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Chmp3Q9CQ10 Gm26441-201ENSMUST00000082590 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Chmp3Q9CQ10 Olfr921-203ENSMUST00000217114 4120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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Chmp3Q9CQ10 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Chmp3Q9CQ10 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Chmp3Q9CQ10 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Chmp3Q9CQ10 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Chmp3Q9CQ10 Gm23468-201ENSMUST00000157125 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Chmp3Q9CQ10 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Chmp3Q9CQ10 Gm25229-201ENSMUST00000178587 79 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Chmp3Q9CQ10 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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Chmp3Q9CQ10 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Chmp3Q9CQ10 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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Chmp3Q9CQ10 Gm25663-201ENSMUST00000157698 135 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Chmp3Q9CQ10 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Chmp3Q9CQ10 Gm37778-201ENSMUST00000191732 190 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Chmp3Q9CQ10 Gm11694-201ENSMUST00000118637 159 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Chmp3Q9CQ10 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Chmp3Q9CQ10 C920009B18Rik-204ENSMUST00000181733 123 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Chmp3Q9CQ10 Ranbp2-ps1-201ENSMUST00000184001 403 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Chmp3Q9CQ10 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Chmp3Q9CQ10 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Chmp3Q9CQ10 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Chmp3Q9CQ10 Gm22677-201ENSMUST00000116977 108 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Chmp3Q9CQ10 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Chmp3Q9CQ10 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Chmp3Q9CQ10 Gm27639-201ENSMUST00000184937 85 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Chmp3Q9CQ10 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Chmp3Q9CQ10 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Chmp3Q9CQ10 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Chmp3Q9CQ10 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Chmp3Q9CQ10 Gm27686-201ENSMUST00000185123 91 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Chmp3Q9CQ10 Gm3702-201ENSMUST00000211754 346 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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