Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
Ccdc18Q640L5 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC-3.47□□□□□ -2.96
Ccdc18Q640L5 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
Ccdc18Q640L5 Gm26398-201ENSMUST00000179015 127 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.97
Ccdc18Q640L5 Gm25870-201ENSMUST00000179845 79 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.97
Ccdc18Q640L5 Mir351-201ENSMUST00000083569 99 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.97
Ccdc18Q640L5 Gm37832-201ENSMUST00000118935 189 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
Ccdc18Q640L5 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
Ccdc18Q640L5 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
Ccdc18Q640L5 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
Ccdc18Q640L5 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
Ccdc18Q640L5 Gm25074-201ENSMUST00000178782 94 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
Ccdc18Q640L5 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
Ccdc18Q640L5 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
Ccdc18Q640L5 AC124687.1-201ENSMUST00000221868 189 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
Ccdc18Q640L5 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
Ccdc18Q640L5 Mir466n-201ENSMUST00000104798 94 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
Ccdc18Q640L5 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
Ccdc18Q640L5 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
Ccdc18Q640L5 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC-3.51□□□□□ -2.97
Ccdc18Q640L5 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
Ccdc18Q640L5 Gm11115-201ENSMUST00000113255 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-3.52□□□□□ -2.97
Ccdc18Q640L5 Gm11694-201ENSMUST00000118637 159 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
Ccdc18Q640L5 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
Ccdc18Q640L5 Gm25313-201ENSMUST00000101817 116 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
Ccdc18Q640L5 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
Ccdc18Q640L5 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
Ccdc18Q640L5 Gm23287-201ENSMUST00000179427 116 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
Ccdc18Q640L5 Gm23143-201ENSMUST00000180137 116 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
Ccdc18Q640L5 Zfp813-ps-201ENSMUST00000186652 2506 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
Ccdc18Q640L5 Gm24871-201ENSMUST00000083099 116 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
Ccdc18Q640L5 Rnu5g-201ENSMUST00000093721 116 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
Ccdc18Q640L5 Mir467e-201ENSMUST00000103760 87 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
Ccdc18Q640L5 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
Ccdc18Q640L5 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
Ccdc18Q640L5 Gm22294-201ENSMUST00000083308 104 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
Ccdc18Q640L5 Mir669h-201ENSMUST00000116944 125 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
Ccdc18Q640L5 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
Ccdc18Q640L5 Gm24806-201ENSMUST00000117036 90 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
Ccdc18Q640L5 AC156790.3-201ENSMUST00000226200 254 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
Ccdc18Q640L5 Gm24538-201ENSMUST00000082612 107 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
Ccdc18Q640L5 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
Ccdc18Q640L5 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
Ccdc18Q640L5 Mir1969-201ENSMUST00000157623 94 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
Ccdc18Q640L5 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
Ccdc18Q640L5 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
Ccdc18Q640L5 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
Ccdc18Q640L5 AC120394.1-201ENSMUST00000217153 351 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
Ccdc18Q640L5 Gm25207-201ENSMUST00000093745 107 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
Ccdc18Q640L5 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC-3.59□□□□□ -2.98
Ccdc18Q640L5 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
Ccdc18Q640L5 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
Ccdc18Q640L5 Gm25619-201ENSMUST00000122621 104 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
Ccdc18Q640L5 Gm23291-201ENSMUST00000175611 78 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
Ccdc18Q640L5 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
Ccdc18Q640L5 Gm24877-201ENSMUST00000158779 116 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
Ccdc18Q640L5 Gm25297-201ENSMUST00000175490 67 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
Ccdc18Q640L5 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
Ccdc18Q640L5 Mir23a-201ENSMUST00000083677 75 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
Ccdc18Q640L5 Gm22572-201ENSMUST00000082985 105 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
Ccdc18Q640L5 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC-3.66□□□□□ -2.99
Ccdc18Q640L5 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
Ccdc18Q640L5 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
Ccdc18Q640L5 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
Ccdc18Q640L5 Gm42677-201ENSMUST00000196363 127 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
Ccdc18Q640L5 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
Ccdc18Q640L5 Gm24918-201ENSMUST00000083022 130 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
Ccdc18Q640L5 Gm25112-201ENSMUST00000122680 104 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
Ccdc18Q640L5 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
Ccdc18Q640L5 Gm22783-201ENSMUST00000104089 107 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
Ccdc18Q640L5 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
Ccdc18Q640L5 Gm23494-201ENSMUST00000116830 126 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
Ccdc18Q640L5 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
Ccdc18Q640L5 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
Ccdc18Q640L5 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
Ccdc18Q640L5 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
Ccdc18Q640L5 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
Ccdc18Q640L5 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
Ccdc18Q640L5 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
Ccdc18Q640L5 AC154506.3-201ENSMUST00000225417 213 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
Ccdc18Q640L5 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
Ccdc18Q640L5 Gm38333-201ENSMUST00000193608 604 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
Ccdc18Q640L5 Gm10715-202ENSMUST00000177969 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC-3.74□□□□□ -3.01
Ccdc18Q640L5 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
Ccdc18Q640L5 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
Ccdc18Q640L5 Mir379-201ENSMUST00000083564 66 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
Ccdc18Q640L5 Gm26479-201ENSMUST00000122620 106 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
Ccdc18Q640L5 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
Ccdc18Q640L5 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
Ccdc18Q640L5 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
Ccdc18Q640L5 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
Ccdc18Q640L5 Gm23570-201ENSMUST00000083029 104 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
Ccdc18Q640L5 Gm22401-201ENSMUST00000174927 117 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
Ccdc18Q640L5 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
Ccdc18Q640L5 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
Ccdc18Q640L5 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-3.79□□□□□ -3.02
Ccdc18Q640L5 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
Ccdc18Q640L5 Gm22402-201ENSMUST00000174920 110 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
Ccdc18Q640L5 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
Ccdc18Q640L5 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms