Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Cpne9Q1RLL3 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Cpne9Q1RLL3 n-R5s42-201ENSMUST00000082697 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Cpne9Q1RLL3 Gm24256-201ENSMUST00000083696 84 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Cpne9Q1RLL3 Gm25040-201ENSMUST00000103877 66 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm26421-201ENSMUST00000104279 132 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm44803-201ENSMUST00000204384 156 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm25791-201ENSMUST00000083292 137 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm14626-201ENSMUST00000117619 216 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm44327-201ENSMUST00000200068 117 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Mir201-201ENSMUST00000083470 66 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Ranbp2-ps1-201ENSMUST00000184001 403 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Mir376b-201ENSMUST00000195930 82 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Mir126a-201ENSMUST00000083606 73 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm45197-201ENSMUST00000205288 151 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm45617-201ENSMUST00000211132 209 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm22813-201ENSMUST00000199948 123 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm24793-201ENSMUST00000104289 132 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm23320-201ENSMUST00000104462 127 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm24129-201ENSMUST00000158537 97 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm25974-201ENSMUST00000158701 94 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm25307-201ENSMUST00000158885 106 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm27446-201ENSMUST00000183963 89 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 AC154245.1-201ENSMUST00000224615 601 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 n-R5s12-201ENSMUST00000083785 119 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm23080-201ENSMUST00000157846 103 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Mir3470a-201ENSMUST00000175223 77 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm29432-201ENSMUST00000185397 139 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Mir191-201ENSMUST00000196210 74 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Mir142b-201ENSMUST00000083486 115 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Mir363-201ENSMUST00000093598 75 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Cpne9Q1RLL3 Gm23661-201ENSMUST00000122630 87 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Cpne9Q1RLL3 Gm24073-201ENSMUST00000158177 106 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Cpne9Q1RLL3 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Cpne9Q1RLL3 Gm25749-201ENSMUST00000175485 111 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Cpne9Q1RLL3 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Cpne9Q1RLL3 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Cpne9Q1RLL3 Gm22087-201ENSMUST00000158339 88 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Cpne9Q1RLL3 Gm22942-201ENSMUST00000158563 124 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Cpne9Q1RLL3 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Cpne9Q1RLL3 Gm22757-201ENSMUST00000102279 96 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Cpne9Q1RLL3 Mir216b-201ENSMUST00000102363 86 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Cpne9Q1RLL3 Gm23159-201ENSMUST00000175088 77 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Cpne9Q1RLL3 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Cpne9Q1RLL3 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.25□□□□□ -2.45
Cpne9Q1RLL3 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
Cpne9Q1RLL3 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Cpne9Q1RLL3 Traj30-201ENSMUST00000103711 59 ntAPPRIS P1 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
Cpne9Q1RLL3 Snord91a-201ENSMUST00000104305 93 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Cpne9Q1RLL3 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Cpne9Q1RLL3 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Cpne9Q1RLL3 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
Cpne9Q1RLL3 Mir327-201ENSMUST00000199328 69 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Cpne9Q1RLL3 Gm44328-201ENSMUST00000199331 75 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Cpne9Q1RLL3 Gm45741-201ENSMUST00000212661 152 ntTSL 1 (best) BASIC-0.26□□□□□ -2.45
Cpne9Q1RLL3 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Cpne9Q1RLL3 Mir214-201ENSMUST00000083582 110 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Cpne9Q1RLL3 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Cpne9Q1RLL3 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Cpne9Q1RLL3 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.27□□□□□ -2.45
Cpne9Q1RLL3 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Cpne9Q1RLL3 mt-Ta-201ENSMUST00000082398 69 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Cpne9Q1RLL3 Mir141-201ENSMUST00000083540 72 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Cpne9Q1RLL3 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Cpne9Q1RLL3 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
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