Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Snord50a-201ENSMUST00000178154 72 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ptchd1Q14B62 Gm24463-201ENSMUST00000178417 72 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ptchd1Q14B62 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ptchd1Q14B62 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ptchd1Q14B62 Gm43206-201ENSMUST00000197990 114 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ptchd1Q14B62 AC132833.2-201ENSMUST00000228699 157 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ptchd1Q14B62 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ptchd1Q14B62 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ptchd1Q14B62 Gm26051-201ENSMUST00000104642 93 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ptchd1Q14B62 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ptchd1Q14B62 Gm25337-201ENSMUST00000083723 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ptchd1Q14B62 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ptchd1Q14B62 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ptchd1Q14B62 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ptchd1Q14B62 Gm23349-201ENSMUST00000158432 98 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ptchd1Q14B62 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ptchd1Q14B62 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ptchd1Q14B62 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ptchd1Q14B62 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ptchd1Q14B62 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ptchd1Q14B62 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ptchd1Q14B62 Gm22454-201ENSMUST00000082583 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ptchd1Q14B62 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ptchd1Q14B62 Gm22354-201ENSMUST00000083919 70 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ptchd1Q14B62 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ptchd1Q14B62 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ptchd1Q14B62 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ptchd1Q14B62 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ptchd1Q14B62 Gm23261-201ENSMUST00000158316 136 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ptchd1Q14B62 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ptchd1Q14B62 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ptchd1Q14B62 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ptchd1Q14B62 Gm25636-201ENSMUST00000082666 133 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ptchd1Q14B62 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ptchd1Q14B62 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ptchd1Q14B62 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ptchd1Q14B62 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ptchd1Q14B62 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ptchd1Q14B62 Gm25663-201ENSMUST00000157698 135 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ptchd1Q14B62 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ptchd1Q14B62 AC122327.1-201ENSMUST00000220778 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ptchd1Q14B62 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm22761-201ENSMUST00000102278 96 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm22672-201ENSMUST00000104414 134 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm24801-201ENSMUST00000178503 105 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm44320-201ENSMUST00000199276 86 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 mt-Tc-201ENSMUST00000082400 66 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm25899-201ENSMUST00000082672 141 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm23344-201ENSMUST00000083818 68 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm25681-201ENSMUST00000083938 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Mir5619-201ENSMUST00000176065 61 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm22827-201ENSMUST00000083766 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm25449-201ENSMUST00000179389 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm25618-201ENSMUST00000179484 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Mir6237-201ENSMUST00000183808 91 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm22679-201ENSMUST00000116975 100 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm26425-201ENSMUST00000122529 82 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm25633-201ENSMUST00000178565 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 AC069074.1-201ENSMUST00000220048 381 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm22805-201ENSMUST00000082739 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm26062-201ENSMUST00000083379 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm14884-201ENSMUST00000120456 196 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 mt-Tn-201ENSMUST00000082399 71 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm24638-201ENSMUST00000179807 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ptchd1Q14B62 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
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