Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm11694-201ENSMUST00000118637 159 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PtpreP49446 Gm24686-201ENSMUST00000157755 93 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PtpreP49446 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PtpreP49446 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PtpreP49446 AC157602.1-201ENSMUST00000197446 105 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PtpreP49446 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PtpreP49446 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Gm21836-201ENSMUST00000178787 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Gm23306-201ENSMUST00000179058 105 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PtpreP49446 AC158537.2-201ENSMUST00000223575 150 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Mir29a-201ENSMUST00000083676 88 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PtpreP49446 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PtpreP49446 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PtpreP49446 AC154506.4-201ENSMUST00000224898 3416 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PtpreP49446 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Gm11111-201ENSMUST00000112956 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Gm25964-201ENSMUST00000157171 97 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Mirlet7a-1-201ENSMUST00000083487 94 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PtpreP49446 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Gm25870-201ENSMUST00000179845 79 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PtpreP49446 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
PtpreP49446 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PtpreP49446 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PtpreP49446 Gm25552-201ENSMUST00000158081 91 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PtpreP49446 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PtpreP49446 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PtpreP49446 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PtpreP49446 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PtpreP49446 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
PtpreP49446 Mir3064-201ENSMUST00000175532 67 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PtpreP49446 Gm26712-201ENSMUST00000180813 217 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PtpreP49446 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PtpreP49446 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PtpreP49446 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PtpreP49446 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PtpreP49446 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PtpreP49446 Traj34-201ENSMUST00000103707 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
PtpreP49446 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PtpreP49446 Mir509-201ENSMUST00000196089 75 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PtpreP49446 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PtpreP49446 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PtpreP49446 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PtpreP49446 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PtpreP49446 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PtpreP49446 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PtpreP49446 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpreP49446 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpreP49446 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtpreP49446 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PtpreP49446 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PtpreP49446 Gm22544-201ENSMUST00000104349 127 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PtpreP49446 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PtpreP49446 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PtpreP49446 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PtpreP49446 Gm23477-201ENSMUST00000158882 128 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PtpreP49446 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PtpreP49446 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PtpreP49446 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PtpreP49446 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PtpreP49446 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PtpreP49446 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PtpreP49446 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PtpreP49446 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PtpreP49446 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PtpreP49446 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PtpreP49446 Gm37824-201ENSMUST00000193430 3236 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PtpreP49446 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PtpreP49446 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PtpreP49446 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PtpreP49446 Gm25609-201ENSMUST00000104019 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PtpreP49446 Mup-ps5-201ENSMUST00000118667 99 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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