Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 AC157602.1-201ENSMUST00000197446 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Mir29a-201ENSMUST00000083676 88 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Gm23477-201ENSMUST00000158882 128 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Gm24686-201ENSMUST00000157755 93 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Gm24547-201ENSMUST00000158649 149 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Gm11694-201ENSMUST00000118637 159 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Gm25609-201ENSMUST00000104019 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Gm25964-201ENSMUST00000157171 97 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Gm37824-201ENSMUST00000193430 3236 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Hoxd9P28357 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Gm24379-201ENSMUST00000122695 86 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Gm22078-201ENSMUST00000157593 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Gm23856-201ENSMUST00000158380 99 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Gm24331-201ENSMUST00000175099 67 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Gm23801-201ENSMUST00000175561 67 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Gm24485-201ENSMUST00000178283 67 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Gm24226-201ENSMUST00000158826 97 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Gm24221-201ENSMUST00000158833 313 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Mir509-201ENSMUST00000196089 75 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Gm25622-201ENSMUST00000157217 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Gm22413-201ENSMUST00000175465 85 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Gm26712-201ENSMUST00000180813 217 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Gm5581-201ENSMUST00000072940 2550 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Gm24701-201ENSMUST00000101946 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Gm25619-201ENSMUST00000122621 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Hoxd9P28357 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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