Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm24952-201ENSMUST00000177909 79 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm25245-201ENSMUST00000178139 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm23682-201ENSMUST00000178146 79 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm24652-201ENSMUST00000178223 79 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm22629-201ENSMUST00000178272 79 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm24021-201ENSMUST00000178435 79 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm22274-201ENSMUST00000178441 79 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm22050-201ENSMUST00000178442 79 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm23688-201ENSMUST00000178502 79 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm23944-201ENSMUST00000178607 79 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm26283-201ENSMUST00000178625 79 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm23610-201ENSMUST00000178659 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm25452-201ENSMUST00000178776 79 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm23286-201ENSMUST00000178963 79 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm22640-201ENSMUST00000179035 79 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm25984-201ENSMUST00000179129 79 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm25585-201ENSMUST00000179469 79 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm23712-201ENSMUST00000179713 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm26374-201ENSMUST00000179737 79 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm24040-201ENSMUST00000179786 79 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm25017-201ENSMUST00000179805 79 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm24870-201ENSMUST00000179897 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm23618-201ENSMUST00000179912 79 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm22645-201ENSMUST00000180010 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm26284-201ENSMUST00000180107 79 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm24570-201ENSMUST00000180314 79 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm24654-201ENSMUST00000180315 79 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 AC154552.5-201ENSMUST00000222352 207 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm23057-201ENSMUST00000082801 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm24448-201ENSMUST00000083979 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.97□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.97□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 AC154506.3-201ENSMUST00000225417 213 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
ApobE9Q414 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC-1.98□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm24592-201ENSMUST00000122505 106 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC-1.98□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm27798-201ENSMUST00000184989 71 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm22089-201ENSMUST00000158336 102 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm25647-201ENSMUST00000101832 78 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm25823-201ENSMUST00000101995 78 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Mir883a-201ENSMUST00000104824 76 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm24220-201ENSMUST00000177753 79 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm25988-201ENSMUST00000177759 79 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm23471-201ENSMUST00000177886 79 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm26488-201ENSMUST00000178225 79 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm23449-201ENSMUST00000179208 79 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm25221-201ENSMUST00000180051 79 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm21940-201ENSMUST00000204940 2278 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm25449-201ENSMUST00000179389 79 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm22294-201ENSMUST00000083308 104 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm25184-201ENSMUST00000157753 163 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Mir1912-201ENSMUST00000175298 87 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC-2.02□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm22406-201ENSMUST00000174923 93 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm45125-201ENSMUST00000206908 151 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm22203-201ENSMUST00000158605 58 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ApobE9Q414 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.74
ApobE9Q414 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.74
ApobE9Q414 Gm26307-201ENSMUST00000157767 126 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
ApobE9Q414 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
ApobE9Q414 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
ApobE9Q414 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
ApobE9Q414 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
ApobE9Q414 Gm24988-201ENSMUST00000104460 121 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
ApobE9Q414 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
ApobE9Q414 Gm23507-201ENSMUST00000083078 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
ApobE9Q414 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
ApobE9Q414 Gm24399-201ENSMUST00000157869 74 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
ApobE9Q414 Gm25014-201ENSMUST00000158401 103 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
ApobE9Q414 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC-2.05□□□□□ -2.74
ApobE9Q414 Gm22197-201ENSMUST00000116866 58 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
ApobE9Q414 Gm22113-201ENSMUST00000158343 104 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
ApobE9Q414 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms