Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm25472-201ENSMUST00000175454 78 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 Gm38295-201ENSMUST00000191951 151 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 Gm44311-201ENSMUST00000196448 69 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 Gm44858-201ENSMUST00000207360 154 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 Gm43927-201ENSMUST00000204599 117 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 Gm23065-201ENSMUST00000158236 130 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 Gm24199-201ENSMUST00000157808 136 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 Gm25974-201ENSMUST00000158701 94 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 Gm23831-201ENSMUST00000158895 85 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 Mir5124b-201ENSMUST00000184251 85 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 Gm25431-201ENSMUST00000101978 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 Gm26011-201ENSMUST00000104410 104 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 Gm26359-201ENSMUST00000158873 101 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 mt-Tc-201ENSMUST00000082400 66 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Ccdc171E9Q1U1 n-R5s8-201ENSMUST00000104121 118 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 Gm24714-201ENSMUST00000102382 101 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 Mir7043-201ENSMUST00000184219 70 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 Gm11116-201ENSMUST00000113257 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 Gm22031-201ENSMUST00000116945 126 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 CT030166.3-201ENSMUST00000223203 193 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 Traj9-201ENSMUST00000103731 58 ntAPPRIS P1 BASIC-1□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 Gm25510-201ENSMUST00000116986 123 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 AC125190.3-201ENSMUST00000223224 121 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 Gm26202-201ENSMUST00000082910 65 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 Gm12924-201ENSMUST00000121747 318 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 Gm25108-201ENSMUST00000122473 78 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 Gm25329-201ENSMUST00000158041 126 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 Gm22938-201ENSMUST00000103956 120 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 Gm22157-201ENSMUST00000158410 104 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 Gm27610-201ENSMUST00000184026 74 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 Gm27639-201ENSMUST00000184937 85 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Ccdc171E9Q1U1 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
Ccdc171E9Q1U1 Gm26233-201ENSMUST00000175530 70 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
Ccdc171E9Q1U1 Gm27977-201ENSMUST00000185159 111 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
Ccdc171E9Q1U1 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
Ccdc171E9Q1U1 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
Ccdc171E9Q1U1 Gm22489-201ENSMUST00000116813 62 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
Ccdc171E9Q1U1 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
Ccdc171E9Q1U1 Gm23715-201ENSMUST00000157354 106 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
Ccdc171E9Q1U1 Gm24073-201ENSMUST00000158177 106 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
Ccdc171E9Q1U1 Gm27297-201ENSMUST00000183395 105 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
Ccdc171E9Q1U1 Mir145b-201ENSMUST00000184434 75 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
Ccdc171E9Q1U1 Gm26131-201ENSMUST00000082725 110 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
Ccdc171E9Q1U1 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Ccdc171E9Q1U1 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Ccdc171E9Q1U1 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Ccdc171E9Q1U1 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Ccdc171E9Q1U1 Snord42b-201ENSMUST00000083742 69 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Ccdc171E9Q1U1 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
Ccdc171E9Q1U1 Mir216b-201ENSMUST00000102363 86 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
Ccdc171E9Q1U1 Gm24211-201ENSMUST00000158264 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
Ccdc171E9Q1U1 Mir384-201ENSMUST00000083565 88 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
Ccdc171E9Q1U1 Gm24704-201ENSMUST00000093715 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
Ccdc171E9Q1U1 Snord67-201ENSMUST00000104033 111 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.8 ms