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Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80
Snx1, Sorting nexin-1, mouse
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522 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Snx1
Q9WV80
AC153930.1-201
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358 nt
TSL 3
BASIC
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□□□□□ -2.36
Snx1
Q9WV80
Gm10139-201
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171 nt
APPRIS P1
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
Snx1
Q9WV80
Gm23301-201
ENSMUST00000082713
65 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
Snx1
Q9WV80
Gm24640-201
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126 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
Gm22626-201
ENSMUST00000116990
126 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
Gm23080-201
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103 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
Gm22239-201
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103 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
Gm23917-201
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BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
Gm24761-201
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127 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
Gm27475-201
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BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
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61 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
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BASIC
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□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
Mir1a-2-201
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BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
Snord80-202
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BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
Gm23303-201
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BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
Gm22259-201
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BASIC
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□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
Gm27694-201
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BASIC
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□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
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BASIC
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□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
Gm44828-201
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BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
Gm44922-201
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BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
AC161426.1-201
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286 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
mt-Ta-201
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69 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
Mir1191-201
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120 nt
BASIC
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□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
Gm23340-201
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□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
Gm25693-201
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BASIC
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□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
Gm26092-201
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BASIC
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□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
Mir669a-1-201
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97 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
Gm37330-201
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BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
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BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
Mir200a-201
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90 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
Mir377-201
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BASIC
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□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
Gm22337-201
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BASIC
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□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
Gm25329-201
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BASIC
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□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
Gm26158-201
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□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
Mir8090-201
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BASIC
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□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
Gm3702-201
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BASIC
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□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
AC211878.4-201
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BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
Snord60-201
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BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
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BASIC
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□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
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BASIC
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□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
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Snx1
Q9WV80
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Snx1
Q9WV80
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BASIC
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□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
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□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
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BASIC
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□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
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Q9WV80
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Q9WV80
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Snx1
Q9WV80
Trbv25-201
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BASIC
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□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
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BASIC
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□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
Mir489-201
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□□□□□ -2.37
Snx1
Q9WV80
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BASIC
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□□□□□ -2.38
Snx1
Q9WV80
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BASIC
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□□□□□ -2.38
Snx1
Q9WV80
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BASIC
0.21
□□□□□ -2.38
Snx1
Q9WV80
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BASIC
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□□□□□ -2.38
Snx1
Q9WV80
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BASIC
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Snx1
Q9WV80
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Snx1
Q9WV80
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BASIC
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Snx1
Q9WV80
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Q9WV80
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Snx1
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BASIC
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Q9WV80
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Snx1
Q9WV80
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109 nt
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Snx1
Q9WV80
Gm45489-201
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443 nt
TSL 3
BASIC
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□□□□□ -2.38
Snx1
Q9WV80
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BASIC
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□□□□□ -2.38
Snx1
Q9WV80
Gm23461-201
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107 nt
BASIC
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Snx1
Q9WV80
Scarna8-201
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BASIC
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Q9WV80
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BASIC
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Snx1
Q9WV80
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Snx1
Q9WV80
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TSL 5
BASIC
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□□□□□ -2.38
Snx1
Q9WV80
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BASIC
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Snx1
Q9WV80
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BASIC
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Snx1
Q9WV80
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TSL 2
BASIC
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Snx1
Q9WV80
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BASIC
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Snx1
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BASIC
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Snx1
Q9WV80
Gm36929-201
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166 nt
TSL 5
BASIC
0.19
□□□□□ -2.38
Snx1
Q9WV80
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5985 nt
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BASIC
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□□□□□ -2.38
Snx1
Q9WV80
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BASIC
0.19
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Snx1
Q9WV80
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BASIC
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□□□□□ -2.38
Snx1
Q9WV80
Gm24238-201
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BASIC
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□□□□□ -2.38
Snx1
Q9WV80
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BASIC
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□□□□□ -2.38
Snx1
Q9WV80
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BASIC
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□□□□□ -2.38
Snx1
Q9WV80
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BASIC
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□□□□□ -2.38
Snx1
Q9WV80
Snord71-201
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BASIC
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□□□□□ -2.38
Snx1
Q9WV80
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BASIC
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□□□□□ -2.38
Snx1
Q9WV80
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BASIC
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□□□□□ -2.38
Snx1
Q9WV80
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105 nt
BASIC
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□□□□□ -2.38
Snx1
Q9WV80
Gm27943-201
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BASIC
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□□□□□ -2.38
Snx1
Q9WV80
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□□□□□ -2.38
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Q9WV80
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Q9WV80
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BASIC
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Snx1
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106 nt
BASIC
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Snx1
Q9WV80
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79 nt
BASIC
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Snx1
Q9WV80
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BASIC
0.16
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Snx1
Q9WV80
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93 nt
BASIC
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Snx1
Q9WV80
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□□□□□ -2.38
Snx1
Q9WV80
Snord61-201
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71 nt
BASIC
0.16
□□□□□ -2.38
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