Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Mir6365-201ENSMUST00000183990 101 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm22753-201ENSMUST00000083657 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm6897-201ENSMUST00000117714 138 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm14758-201ENSMUST00000119104 138 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm22145-201ENSMUST00000157396 148 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm25749-201ENSMUST00000175485 111 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm23690-201ENSMUST00000083036 94 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.17□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm28435-201ENSMUST00000185496 108 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm24278-201ENSMUST00000104239 127 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm22850-201ENSMUST00000157714 82 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm22612-201ENSMUST00000158293 101 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC0.16□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm26303-201ENSMUST00000116845 119 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm23989-201ENSMUST00000117030 66 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm22706-201ENSMUST00000157907 112 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm22087-201ENSMUST00000158339 88 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm22234-201ENSMUST00000174906 65 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm22239-201ENSMUST00000175220 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Snora16a-202ENSMUST00000196061 137 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC0.15□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Mir200a-201ENSMUST00000083466 90 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Mir382-201ENSMUST00000083494 76 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Traj38-201ENSMUST00000103704 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.13□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm27993-201ENSMUST00000184362 85 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Snord95-201ENSMUST00000082846 68 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm23080-201ENSMUST00000157846 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm27475-201ENSMUST00000183420 61 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Mir7065-201ENSMUST00000185110 61 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm3702-201ENSMUST00000211754 346 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm25894-201ENSMUST00000083458 75 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Gm24030-201ENSMUST00000083931 164 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Col5a3Q9JLI2 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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