Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RpainQ9CWY9 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RpainQ9CWY9 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RpainQ9CWY9 Gm23369-201ENSMUST00000175406 105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RpainQ9CWY9 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RpainQ9CWY9 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RpainQ9CWY9 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RpainQ9CWY9 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RpainQ9CWY9 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RpainQ9CWY9 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RpainQ9CWY9 Mir5619-201ENSMUST00000176065 61 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RpainQ9CWY9 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RpainQ9CWY9 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RpainQ9CWY9 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RpainQ9CWY9 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RpainQ9CWY9 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RpainQ9CWY9 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RpainQ9CWY9 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RpainQ9CWY9 Gm22503-201ENSMUST00000158983 115 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RpainQ9CWY9 Gm24801-201ENSMUST00000178503 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RpainQ9CWY9 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RpainQ9CWY9 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RpainQ9CWY9 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RpainQ9CWY9 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RpainQ9CWY9 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RpainQ9CWY9 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RpainQ9CWY9 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RpainQ9CWY9 Gm37778-201ENSMUST00000191732 190 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RpainQ9CWY9 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RpainQ9CWY9 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RpainQ9CWY9 Gm25337-201ENSMUST00000083723 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RpainQ9CWY9 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
RpainQ9CWY9 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RpainQ9CWY9 Gm24946-201ENSMUST00000158332 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RpainQ9CWY9 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RpainQ9CWY9 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RpainQ9CWY9 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RpainQ9CWY9 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RpainQ9CWY9 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RpainQ9CWY9 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RpainQ9CWY9 Gm26369-201ENSMUST00000157825 100 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RpainQ9CWY9 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RpainQ9CWY9 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RpainQ9CWY9 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RpainQ9CWY9 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RpainQ9CWY9 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RpainQ9CWY9 Gm22540-201ENSMUST00000158168 117 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RpainQ9CWY9 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RpainQ9CWY9 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RpainQ9CWY9 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RpainQ9CWY9 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RpainQ9CWY9 AC069074.1-201ENSMUST00000220048 381 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RpainQ9CWY9 Gm25636-201ENSMUST00000082666 133 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RpainQ9CWY9 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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RpainQ9CWY9 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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RpainQ9CWY9 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RpainQ9CWY9 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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RpainQ9CWY9 Mir6237-201ENSMUST00000183808 91 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RpainQ9CWY9 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RpainQ9CWY9 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RpainQ9CWY9 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RpainQ9CWY9 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RpainQ9CWY9 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RpainQ9CWY9 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RpainQ9CWY9 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RpainQ9CWY9 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RpainQ9CWY9 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
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RpainQ9CWY9 Mir764-201ENSMUST00000103259 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Gm23468-201ENSMUST00000157125 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Gm24637-201ENSMUST00000158674 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Gm26441-201ENSMUST00000082590 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Gm24593-201ENSMUST00000122507 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 mt-Tc-201ENSMUST00000082400 66 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Gm22605-201ENSMUST00000158289 108 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RpainQ9CWY9 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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