Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Chmp3Q9CQ10 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Chmp3Q9CQ10 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Chmp3Q9CQ10 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Chmp3Q9CQ10 Mir764-201ENSMUST00000103259 108 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm25337-201ENSMUST00000083723 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm22672-201ENSMUST00000104414 134 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm25730-201ENSMUST00000178753 165 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm22943-201ENSMUST00000158564 76 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm26425-201ENSMUST00000122529 82 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Chmp3Q9CQ10 Gm25112-201ENSMUST00000122680 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Gm25449-201ENSMUST00000179389 79 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Mir6237-201ENSMUST00000183808 91 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Gm24801-201ENSMUST00000178503 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Gm25045-201ENSMUST00000122670 99 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Gm22069-201ENSMUST00000179911 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Gm20118-201ENSMUST00000187207 162 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Gm25899-201ENSMUST00000082672 141 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Mir5619-201ENSMUST00000176065 61 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Gm26398-201ENSMUST00000179015 127 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 mt-Tc-201ENSMUST00000082400 66 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Chmp3Q9CQ10 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Chmp3Q9CQ10 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Chmp3Q9CQ10 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Chmp3Q9CQ10 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Chmp3Q9CQ10 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Chmp3Q9CQ10 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Chmp3Q9CQ10 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 331.8 ms