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Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4
Snx8, Sorting nexin-8, mouse
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Snx8
Q8CFD4
Gm24238-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Snx8
Q8CFD4
Snora15-201
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131 nt
BASIC
0.05
□□□□□ -2.4
Snx8
Q8CFD4
Gm24761-201
ENSMUST00000179589
127 nt
BASIC
0.05
□□□□□ -2.4
Snx8
Q8CFD4
Mir6342-201
ENSMUST00000183870
125 nt
BASIC
0.05
□□□□□ -2.4
Snx8
Q8CFD4
Mir6896-201
ENSMUST00000198033
73 nt
BASIC
0.05
□□□□□ -2.4
Snx8
Q8CFD4
Gm45489-201
ENSMUST00000211753
443 nt
TSL 3
BASIC
0.05
□□□□□ -2.4
Snx8
Q8CFD4
Gm11936-201
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160 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
Snx8
Q8CFD4
Gm25718-201
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118 nt
BASIC
0.04
□□□□□ -2.4
Snx8
Q8CFD4
Gm23003-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Snx8
Q8CFD4
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Snx8
Q8CFD4
Mir8107-201
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117 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
Snx8
Q8CFD4
Mir8116-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Snx8
Q8CFD4
Gm37586-201
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204 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
Snx8
Q8CFD4
Gm25408-201
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133 nt
BASIC
0.03
□□□□□ -2.4
Snx8
Q8CFD4
Gm22541-201
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127 nt
BASIC
0.03
□□□□□ -2.4
Snx8
Q8CFD4
Gm22612-201
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101 nt
BASIC
0.03
□□□□□ -2.4
Snx8
Q8CFD4
Gm25654-201
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88 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
Snx8
Q8CFD4
Gm22946-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Snx8
Q8CFD4
Gm25749-201
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BASIC
0.03
□□□□□ -2.4
Snx8
Q8CFD4
Gm25633-201
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107 nt
BASIC
0.03
□□□□□ -2.4
Snx8
Q8CFD4
Gm29535-201
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109 nt
BASIC
0.03
□□□□□ -2.4
Snx8
Q8CFD4
Gm28143-201
ENSMUST00000191082
109 nt
BASIC
0.03
□□□□□ -2.4
Snx8
Q8CFD4
Gm37116-201
ENSMUST00000195161
147 nt
BASIC
0.03
□□□□□ -2.4
Snx8
Q8CFD4
Gm5002-201
ENSMUST00000207145
223 nt
BASIC
0.03
□□□□□ -2.4
Snx8
Q8CFD4
AL606472.1-201
ENSMUST00000224628
275 nt
BASIC
0.03
□□□□□ -2.4
Snx8
Q8CFD4
Gm25703-201
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151 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
Snx8
Q8CFD4
Gm45265-201
ENSMUST00000210852
2497 nt
BASIC
0.02
□□□□□ -2.41
Snx8
Q8CFD4
Gm14626-201
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216 nt
BASIC
0.02
□□□□□ -2.41
Snx8
Q8CFD4
Gm37998-201
ENSMUST00000195699
166 nt
TSL 5
BASIC
0.02
□□□□□ -2.41
Snx8
Q8CFD4
Mir201-201
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66 nt
BASIC
0.02
□□□□□ -2.41
Snx8
Q8CFD4
Mir20b-201
ENSMUST00000102087
80 nt
BASIC
0.01
□□□□□ -2.41
Snx8
Q8CFD4
Gm23545-201
ENSMUST00000158205
104 nt
BASIC
0.01
□□□□□ -2.41
Snx8
Q8CFD4
Mir1949-202
ENSMUST00000199259
70 nt
BASIC
0.01
□□□□□ -2.41
Snx8
Q8CFD4
AC136457.1-201
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156 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
Snx8
Q8CFD4
AC122320.1-201
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105 nt
BASIC
0.01
□□□□□ -2.41
Snx8
Q8CFD4
Gm12469-201
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207 nt
BASIC
0
□□□□□ -2.41
Snx8
Q8CFD4
Gm25693-201
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BASIC
-0.01
□□□□□ -2.41
Snx8
Q8CFD4
Gm23141-201
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94 nt
BASIC
-0.01
□□□□□ -2.41
Snx8
Q8CFD4
Mir7657-201
ENSMUST00000196051
57 nt
BASIC
-0.01
□□□□□ -2.41
Snx8
Q8CFD4
Snord82-201
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70 nt
BASIC
-0.01
□□□□□ -2.41
Snx8
Q8CFD4
Gm25496-201
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120 nt
BASIC
-0.02
□□□□□ -2.41
Snx8
Q8CFD4
Gm23772-201
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102 nt
BASIC
-0.02
□□□□□ -2.41
Snx8
Q8CFD4
Gm22030-201
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63 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
Snx8
Q8CFD4
Gm24225-201
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98 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
Snx8
Q8CFD4
Gm20409-201
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130 nt
BASIC
-0.02
□□□□□ -2.41
Snx8
Q8CFD4
AC154245.1-201
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BASIC
-0.02
□□□□□ -2.41
Snx8
Q8CFD4
Gm22368-201
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109 nt
BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
Snx8
Q8CFD4
Olfr1172-ps1-201
ENSMUST00000121530
192 nt
BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
Snx8
Q8CFD4
Trbv25-201
ENSMUST00000194700
273 nt
BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
Snx8
Q8CFD4
Gm22303-201
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122 nt
BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
Snx8
Q8CFD4
Mir200b-201
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BASIC
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□□□□□ -2.41
Snx8
Q8CFD4
Gm13065-201
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141 nt
BASIC
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□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
Gm27980-201
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169 nt
BASIC
-0.04
□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
Mir3969-201
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92 nt
BASIC
-0.04
□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
Mir196a-2-201
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85 nt
BASIC
-0.04
□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
Rab11fip4os2-202
ENSMUST00000132921
355 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-0.05
□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
Gm25390-201
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BASIC
-0.05
□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
Gm24290-201
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96 nt
BASIC
-0.05
□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
Gm23080-201
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BASIC
-0.05
□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
Gm24772-201
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110 nt
BASIC
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□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
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BASIC
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□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
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BASIC
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□□□□□ -2.42
Snx8
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BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
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BASIC
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□□□□□ -2.42
Snx8
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BASIC
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□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
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□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
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TSL 5
BASIC
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□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
Gm28575-201
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TSL 5
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
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166 nt
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BASIC
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□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
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166 nt
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BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
Gm28858-201
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166 nt
TSL 5
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
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TSL 5
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
Gm28336-201
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166 nt
TSL 5
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
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166 nt
TSL 5
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
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151 nt
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
Gm25040-201
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66 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
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93 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
Gm25329-201
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126 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
Gm27446-201
ENSMUST00000183963
89 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
Gm38208-201
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114 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
CT009723.2-201
ENSMUST00000215702
124 nt
TSL 5
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
Gm23783-201
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102 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
Gm24129-201
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97 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
Gm25834-201
ENSMUST00000158916
101 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
Mir376b-201
ENSMUST00000195930
82 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
Gm25136-201
ENSMUST00000083253
115 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
Gm43885-201
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2542 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
Gm24233-201
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122 nt
BASIC
-0.09
□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
Gm24132-201
ENSMUST00000104745
91 nt
BASIC
-0.09
□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
Gm25600-201
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106 nt
BASIC
-0.09
□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
Gm23859-201
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64 nt
BASIC
-0.09
□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
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105 nt
BASIC
-0.09
□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
Gm44328-201
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75 nt
BASIC
-0.09
□□□□□ -2.42
Snx8
Q8CFD4
Gm24555-201
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124 nt
BASIC
-0.1
□□□□□ -2.43
Snx8
Q8CFD4
Gm25309-201
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126 nt
BASIC
-0.1
□□□□□ -2.43
Snx8
Q8CFD4
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BASIC
-0.1
□□□□□ -2.43
Snx8
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BASIC
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□□□□□ -2.43
Snx8
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Gm43381-201
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Snx8
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Snx8
Q8CFD4
Gm23060-201
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109 nt
BASIC
-0.11
□□□□□ -2.43
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