Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ubash3bQ8BGG7 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ubash3bQ8BGG7 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ubash3bQ8BGG7 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ubash3bQ8BGG7 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ubash3bQ8BGG7 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ubash3bQ8BGG7 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm27639-201ENSMUST00000184937 85 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm3702-201ENSMUST00000211754 346 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm26062-201ENSMUST00000083379 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Traj42-201ENSMUST00000103700 64 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm22067-201ENSMUST00000122790 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm23056-201ENSMUST00000082803 111 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm27975-201ENSMUST00000184400 101 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm27686-201ENSMUST00000185123 91 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm22140-201ENSMUST00000158745 120 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm24674-201ENSMUST00000179194 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm22205-201ENSMUST00000122655 71 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm25635-201ENSMUST00000082675 131 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm23715-201ENSMUST00000157354 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm24399-201ENSMUST00000157869 74 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm27987-201ENSMUST00000184023 93 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm25644-201ENSMUST00000083209 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Olfr921-203ENSMUST00000217114 4120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm23528-201ENSMUST00000104571 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm25014-201ENSMUST00000158401 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Snora26-201ENSMUST00000175614 121 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm23293-201ENSMUST00000082552 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm23237-201ENSMUST00000104639 92 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm14884-201ENSMUST00000120456 196 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm24183-201ENSMUST00000122572 93 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm23900-201ENSMUST00000157569 108 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm22458-201ENSMUST00000082576 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.1 ms