Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25680-201ENSMUST00000116917 126 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22635-201ENSMUST00000116962 126 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25045-201ENSMUST00000122670 99 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22319-201ENSMUST00000157147 122 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22827-201ENSMUST00000083766 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24099-201ENSMUST00000083384 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25681-201ENSMUST00000083938 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25887-201ENSMUST00000157777 84 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22770-201ENSMUST00000158368 67 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22354-201ENSMUST00000083919 70 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1154-203ENSMUST00000215862 2624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24947-201ENSMUST00000158334 110 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23384-201ENSMUST00000158593 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26466-201ENSMUST00000179615 79 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22454-201ENSMUST00000082583 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23790-201ENSMUST00000083013 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25730-201ENSMUST00000178753 165 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24649-201ENSMUST00000157106 134 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22983-201ENSMUST00000158308 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Traj61-201ENSMUST00000165025 72 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25633-201ENSMUST00000178565 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43977-201ENSMUST00000203970 189 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22805-201ENSMUST00000082739 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23351-201ENSMUST00000158427 125 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22071-201ENSMUST00000116857 83 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23986-201ENSMUST00000157144 63 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Pdzrn3Q69ZS0 AC069074.1-201ENSMUST00000220048 381 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24379-201ENSMUST00000122695 86 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Pdzrn3Q69ZS0 AC166341.8-201ENSMUST00000221267 108 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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