Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
Ccdc18Q640L5 Mir335-201ENSMUST00000083567 98 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
Ccdc18Q640L5 Gm25684-201ENSMUST00000083941 107 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
Ccdc18Q640L5 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
Ccdc18Q640L5 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
Ccdc18Q640L5 Mir29b-1-201ENSMUST00000083670 71 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
Ccdc18Q640L5 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
Ccdc18Q640L5 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
Ccdc18Q640L5 Gm25493-201ENSMUST00000157375 103 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
Ccdc18Q640L5 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
Ccdc18Q640L5 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
Ccdc18Q640L5 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC-3.26□□□□□ -2.93
Ccdc18Q640L5 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
Ccdc18Q640L5 Snord2-201ENSMUST00000157899 69 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
Ccdc18Q640L5 Gm22183-201ENSMUST00000175420 73 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
Ccdc18Q640L5 Gm22638-201ENSMUST00000179674 107 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
Ccdc18Q640L5 Gm24717-201ENSMUST00000157522 124 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
Ccdc18Q640L5 Gm27784-201ENSMUST00000184926 113 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
Ccdc18Q640L5 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC-3.28□□□□□ -2.93
Ccdc18Q640L5 Gm25056-201ENSMUST00000157372 62 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.94
Ccdc18Q640L5 AC112972.1-201ENSMUST00000227329 365 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.94
Ccdc18Q640L5 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC-3.28□□□□□ -2.94
Ccdc18Q640L5 Gm38261-201ENSMUST00000192608 316 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
Ccdc18Q640L5 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
Ccdc18Q640L5 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
Ccdc18Q640L5 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
Ccdc18Q640L5 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
Ccdc18Q640L5 Gm24064-201ENSMUST00000157486 106 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
Ccdc18Q640L5 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
Ccdc18Q640L5 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
Ccdc18Q640L5 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
Ccdc18Q640L5 Gm26438-201ENSMUST00000082593 107 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
Ccdc18Q640L5 Gm24701-201ENSMUST00000101946 105 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
Ccdc18Q640L5 n-R5s155-201ENSMUST00000122531 113 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
Ccdc18Q640L5 Gm23566-201ENSMUST00000174907 108 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
Ccdc18Q640L5 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC-3.33□□□□□ -2.94
Ccdc18Q640L5 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
Ccdc18Q640L5 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
Ccdc18Q640L5 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
Ccdc18Q640L5 Gm22464-201ENSMUST00000175273 64 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
Ccdc18Q640L5 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
Ccdc18Q640L5 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
Ccdc18Q640L5 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.94
Ccdc18Q640L5 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.94
Ccdc18Q640L5 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-3.35□□□□□ -2.95
Ccdc18Q640L5 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
Ccdc18Q640L5 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC-3.35□□□□□ -2.95
Ccdc18Q640L5 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
Ccdc18Q640L5 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
Ccdc18Q640L5 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
Ccdc18Q640L5 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
Ccdc18Q640L5 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-3.37□□□□□ -2.95
Ccdc18Q640L5 Gm22539-201ENSMUST00000158167 117 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
Ccdc18Q640L5 Gm29513-201ENSMUST00000185741 202 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
Ccdc18Q640L5 Gm22004-201ENSMUST00000101884 107 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
Ccdc18Q640L5 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
Ccdc18Q640L5 Gm22113-201ENSMUST00000158343 104 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
Ccdc18Q640L5 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
Ccdc18Q640L5 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-3.38□□□□□ -2.95
Ccdc18Q640L5 Gm43907-201ENSMUST00000203128 117 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
Ccdc18Q640L5 Gm22216-201ENSMUST00000157557 114 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
Ccdc18Q640L5 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-3.39□□□□□ -2.95
Ccdc18Q640L5 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-3.39□□□□□ -2.95
Ccdc18Q640L5 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC-3.39□□□□□ -2.95
Ccdc18Q640L5 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC-3.4□□□□□ -2.95
Ccdc18Q640L5 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
Ccdc18Q640L5 Gm25329-201ENSMUST00000158041 126 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
Ccdc18Q640L5 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC-3.4□□□□□ -2.95
Ccdc18Q640L5 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
Ccdc18Q640L5 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.95
Ccdc18Q640L5 Gm13720-201ENSMUST00000120741 196 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.95
Ccdc18Q640L5 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.95
Ccdc18Q640L5 AC164297.5-201ENSMUST00000224365 198 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.95
Ccdc18Q640L5 AC167192.2-201ENSMUST00000224794 198 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.95
Ccdc18Q640L5 Gm23093-201ENSMUST00000083450 102 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.95
Ccdc18Q640L5 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
Ccdc18Q640L5 Gm18242-201ENSMUST00000218455 542 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
Ccdc18Q640L5 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
Ccdc18Q640L5 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
Ccdc18Q640L5 Gm38050-201ENSMUST00000191904 238 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
Ccdc18Q640L5 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
Ccdc18Q640L5 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
Ccdc18Q640L5 Gm23261-201ENSMUST00000158316 136 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
Ccdc18Q640L5 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
Ccdc18Q640L5 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
Ccdc18Q640L5 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
Ccdc18Q640L5 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
Ccdc18Q640L5 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
Ccdc18Q640L5 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
Ccdc18Q640L5 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
Ccdc18Q640L5 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
Ccdc18Q640L5 Gm43324-201ENSMUST00000197482 289 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
Ccdc18Q640L5 Gm24461-201ENSMUST00000082735 103 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
Ccdc18Q640L5 Mir7-1-201ENSMUST00000083500 108 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
Ccdc18Q640L5 Mir494-201ENSMUST00000093632 85 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
Ccdc18Q640L5 Gm24775-201ENSMUST00000157377 99 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
Ccdc18Q640L5 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
Ccdc18Q640L5 Gm14533-201ENSMUST00000117088 93 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
Ccdc18Q640L5 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
Ccdc18Q640L5 Gm23900-201ENSMUST00000157569 108 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms