Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PtprnQ60673 Gm23528-201ENSMUST00000104571 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PtprnQ60673 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PtprnQ60673 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PtprnQ60673 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PtprnQ60673 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PtprnQ60673 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PtprnQ60673 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PtprnQ60673 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PtprnQ60673 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PtprnQ60673 Gm24399-201ENSMUST00000157869 74 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PtprnQ60673 Gm22732-201ENSMUST00000158093 121 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PtprnQ60673 Gm25014-201ENSMUST00000158401 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PtprnQ60673 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PtprnQ60673 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PtprnQ60673 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PtprnQ60673 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PtprnQ60673 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PtprnQ60673 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PtprnQ60673 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PtprnQ60673 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PtprnQ60673 Gm11966-201ENSMUST00000119907 87 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PtprnQ60673 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PtprnQ60673 Gm26485-201ENSMUST00000158019 64 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PtprnQ60673 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PtprnQ60673 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PtprnQ60673 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PtprnQ60673 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtprnQ60673 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtprnQ60673 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtprnQ60673 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtprnQ60673 Gm23570-201ENSMUST00000083029 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PtprnQ60673 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PtprnQ60673 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PtprnQ60673 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PtprnQ60673 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PtprnQ60673 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PtprnQ60673 Gm45197-201ENSMUST00000205288 151 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PtprnQ60673 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PtprnQ60673 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Gm24396-201ENSMUST00000116905 93 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Gm25322-201ENSMUST00000122556 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Gm24199-201ENSMUST00000157808 136 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Gm23900-201ENSMUST00000157569 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Gm26133-201ENSMUST00000157363 100 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Gm25160-201ENSMUST00000158914 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Gm24868-201ENSMUST00000157265 136 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Gm24077-201ENSMUST00000158183 136 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Gm23726-201ENSMUST00000178937 67 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PtprnQ60673 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PtprnQ60673 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PtprnQ60673 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PtprnQ60673 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PtprnQ60673 Gm11694-201ENSMUST00000118637 159 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PtprnQ60673 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PtprnQ60673 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PtprnQ60673 AC160976.1-201ENSMUST00000215092 148 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PtprnQ60673 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PtprnQ60673 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PtprnQ60673 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PtprnQ60673 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PtprnQ60673 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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