Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 Olfr1154-203ENSMUST00000215862 2624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Sh3bp1P55194 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Gm24449-201ENSMUST00000083985 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Gm23260-201ENSMUST00000158317 172 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Mir669j-201ENSMUST00000179023 121 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Gm22297-201ENSMUST00000083312 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Gm22681-201ENSMUST00000083853 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Gm26084-201ENSMUST00000157903 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Gm10351-201ENSMUST00000087694 125 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Gm22673-201ENSMUST00000104415 131 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Gm24246-201ENSMUST00000157315 132 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Gm25428-201ENSMUST00000157608 114 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps69-201ENSMUST00000172759 201 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Gm27656-201ENSMUST00000185055 80 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Gm44734-201ENSMUST00000206025 237 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Gm24718-201ENSMUST00000157521 136 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Gm17490-201ENSMUST00000166779 63 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Gm10813-201ENSMUST00000099936 90 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Gm11250-201ENSMUST00000142137 306 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Sh3bp1P55194 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Mir33-201ENSMUST00000083531 69 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm14626-201ENSMUST00000117619 216 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 AC158982.2-201ENSMUST00000226283 184 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm24030-201ENSMUST00000083931 164 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm22384-201ENSMUST00000158187 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm38113-201ENSMUST00000193704 201 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm25425-201ENSMUST00000157611 96 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm25329-201ENSMUST00000158041 126 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm25367-201ENSMUST00000158846 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm38323-201ENSMUST00000192450 210 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm22003-201ENSMUST00000101885 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm24676-201ENSMUST00000158758 75 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm23410-201ENSMUST00000179967 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm22756-201ENSMUST00000180118 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm22505-201ENSMUST00000082956 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm22544-201ENSMUST00000104349 127 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm15289-201ENSMUST00000117793 244 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Mir6380-201ENSMUST00000184334 81 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Gm26454-201ENSMUST00000082682 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Sh3bp1P55194 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.3 ms