Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Gm23507-201ENSMUST00000083078 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Mir7-1-201ENSMUST00000083500 108 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Gm26421-201ENSMUST00000104279 132 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Sult1c2-ps2-201ENSMUST00000196414 276 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 mt-Tv-201ENSMUST00000082389 69 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Gm22772-201ENSMUST00000104451 121 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Traj61-201ENSMUST00000165025 72 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Gm23244-201ENSMUST00000083375 92 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Mir6394-201ENSMUST00000184738 99 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Snord78-201ENSMUST00000104032 66 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Gm22212-201ENSMUST00000158096 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RabggtbP53612 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Gm24649-201ENSMUST00000157106 134 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Gm25887-201ENSMUST00000157777 84 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Gm25730-201ENSMUST00000178753 165 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Gm25680-201ENSMUST00000116917 126 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Gm22635-201ENSMUST00000116962 126 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Gm24947-201ENSMUST00000158334 110 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Gm22429-201ENSMUST00000158553 130 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Gm27656-201ENSMUST00000185055 80 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Gm23347-201ENSMUST00000083823 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Gm23384-201ENSMUST00000158593 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Gm44734-201ENSMUST00000206025 237 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Gm23986-201ENSMUST00000157144 63 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Gm22319-201ENSMUST00000157147 122 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Gm42506-201ENSMUST00000202009 150 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RabggtbP53612 Zfp813-ps-201ENSMUST00000186652 2506 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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