Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Gm28435-201ENSMUST00000185496 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Gm29047-201ENSMUST00000189816 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Gm26207-201ENSMUST00000082909 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 AC154506.4-201ENSMUST00000224898 3416 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm25552-201ENSMUST00000158081 91 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm25636-201ENSMUST00000082666 133 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm24399-201ENSMUST00000157869 74 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm26499-201ENSMUST00000178544 79 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm26096-201ENSMUST00000179084 79 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm44490-201ENSMUST00000198566 127 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm23900-201ENSMUST00000157569 108 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm45197-201ENSMUST00000205288 151 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 AC160976.1-201ENSMUST00000215092 148 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm11111-201ENSMUST00000112956 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm26133-201ENSMUST00000157363 100 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd9P28357 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Mirlet7a-1-201ENSMUST00000083487 94 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Gm23306-201ENSMUST00000179058 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Gm25870-201ENSMUST00000179845 79 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 AC158537.2-201ENSMUST00000223575 150 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Traj34-201ENSMUST00000103707 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Mir3064-201ENSMUST00000175532 67 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Hoxd9P28357 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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