Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm44375-201ENSMUST00000196657 150 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ggta1P23336 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ggta1P23336 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ggta1P23336 Mir145a-201ENSMUST00000083658 70 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ggta1P23336 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ggta1P23336 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ggta1P23336 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ggta1P23336 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ggta1P23336 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ggta1P23336 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ggta1P23336 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ggta1P23336 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ggta1P23336 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ggta1P23336 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ggta1P23336 Gm24129-201ENSMUST00000158537 97 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ggta1P23336 Gm25032-201ENSMUST00000175411 84 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ggta1P23336 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ggta1P23336 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ggta1P23336 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ggta1P23336 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ggta1P23336 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ggta1P23336 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ggta1P23336 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ggta1P23336 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ggta1P23336 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ggta1P23336 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ggta1P23336 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ggta1P23336 Gm26712-201ENSMUST00000180813 217 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ggta1P23336 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ggta1P23336 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ggta1P23336 Gm25756-201ENSMUST00000103990 136 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Gm14947-201ENSMUST00000133704 303 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Snora16a-202ENSMUST00000196061 137 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Gm45741-201ENSMUST00000212661 152 ntTSL 1 (best) BASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Gm22838-201ENSMUST00000158437 99 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Gm23690-201ENSMUST00000083036 94 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Gm24211-201ENSMUST00000158264 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Gm24823-201ENSMUST00000175092 91 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Gm26207-201ENSMUST00000082909 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Mir344-2-201ENSMUST00000175446 80 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Gm25772-201ENSMUST00000158574 56 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Mir7038-201ENSMUST00000184833 71 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ggta1P23336 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ggta1P23336 Gm12924-201ENSMUST00000121747 318 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ggta1P23336 Gm24868-201ENSMUST00000157265 136 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ggta1P23336 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ggta1P23336 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ggta1P23336 Gm24077-201ENSMUST00000158183 136 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ggta1P23336 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ggta1P23336 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ggta1P23336 Gm23442-201ENSMUST00000082919 134 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ggta1P23336 Mir363-201ENSMUST00000093598 75 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ggta1P23336 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Ggta1P23336 Gm25974-201ENSMUST00000158701 94 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Ggta1P23336 Gm25596-201ENSMUST00000178368 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Ggta1P23336 Gm43927-201ENSMUST00000204599 117 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Ggta1P23336 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Ggta1P23336 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Ggta1P23336 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Ggta1P23336 Gm25328-201ENSMUST00000175013 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Ggta1P23336 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Ggta1P23336 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Ggta1P23336 Gm37750-201ENSMUST00000193563 129 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Ggta1P23336 mt-Tl1-201ENSMUST00000082391 75 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Ggta1P23336 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
Ggta1P23336 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Ggta1P23336 Gm24843-201ENSMUST00000158682 76 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Ggta1P23336 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Ggta1P23336 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Ggta1P23336 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms