Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 AC126939.1-201ENSMUST00000224943 226 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm24913-201ENSMUST00000157286 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 AC147101.2-201ENSMUST00000219756 184 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Snord64-201ENSMUST00000104003 67 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm22558-201ENSMUST00000157326 95 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm23044-201ENSMUST00000157891 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Traj61-201ENSMUST00000165025 72 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Olfr307-203ENSMUST00000217494 4515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm44385-201ENSMUST00000198781 81 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.85□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Olfr880-ps1-201ENSMUST00000212344 229 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm22753-201ENSMUST00000083657 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm22196-201ENSMUST00000116865 109 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm25680-201ENSMUST00000116917 126 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm22635-201ENSMUST00000116962 126 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Cldn34c2J3QNM1 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm38323-201ENSMUST00000192450 210 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm24547-201ENSMUST00000158649 149 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm26029-201ENSMUST00000158659 132 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm25006-201ENSMUST00000083813 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm36956-201ENSMUST00000193830 214 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm12086-201ENSMUST00000120863 228 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm22638-201ENSMUST00000179674 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Mir21c-201ENSMUST00000184910 78 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm23138-201ENSMUST00000083365 103 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Mir764-201ENSMUST00000103259 108 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm12013-201ENSMUST00000121971 155 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm23434-201ENSMUST00000157179 100 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.2 ms