Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gm45688-201ENSMUST00000210002 101 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Ccdc171E9Q1U1 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
Ccdc171E9Q1U1 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Ccdc171E9Q1U1 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Ccdc171E9Q1U1 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Ccdc171E9Q1U1 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ccdc171E9Q1U1 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ccdc171E9Q1U1 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ccdc171E9Q1U1 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm14626-201ENSMUST00000117619 216 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm22100-201ENSMUST00000157926 63 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm24508-201ENSMUST00000180104 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.79□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm37750-201ENSMUST00000193563 129 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm28927-201ENSMUST00000191528 272 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm25756-201ENSMUST00000103990 136 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm25773-201ENSMUST00000116718 127 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm27735-201ENSMUST00000185085 76 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm24468-201ENSMUST00000104489 104 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm24129-201ENSMUST00000158537 97 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Mirlet7d-201ENSMUST00000083519 103 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm22827-201ENSMUST00000083766 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC-0.85□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm22813-202ENSMUST00000200346 124 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm39149-201ENSMUST00000210258 186 ntTSL 5 BASIC-0.85□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Mir96-201ENSMUST00000083652 106 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Mir3101-201ENSMUST00000175607 88 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Mir6904-201ENSMUST00000183443 67 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Mir669m-1-201ENSMUST00000158945 98 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm25249-201ENSMUST00000175471 78 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm27884-201ENSMUST00000183865 76 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Snora62-201ENSMUST00000082991 149 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Mir18b-201ENSMUST00000103923 83 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm24593-201ENSMUST00000122507 106 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm26401-201ENSMUST00000158502 76 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm6293-201ENSMUST00000050339 195 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm26007-201ENSMUST00000158798 120 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm23056-201ENSMUST00000082803 111 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ccdc171E9Q1U1 Mir7651-201ENSMUST00000184154 64 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 271.8 ms