Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Gm37778-201ENSMUST00000191732 190 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RabggtaQ9JHK4 Gm22845-201ENSMUST00000157712 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Gm23654-201ENSMUST00000116758 126 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Gm25678-201ENSMUST00000174984 73 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Gm22638-201ENSMUST00000179674 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Gm28270-201ENSMUST00000188550 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Gm28328-201ENSMUST00000188869 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 AC160962.3-201ENSMUST00000225914 112 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Gm24468-201ENSMUST00000104489 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 C920009B18Rik-204ENSMUST00000181733 123 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 AC124687.1-201ENSMUST00000221868 189 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Gm24165-201ENSMUST00000082718 128 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Gm23507-201ENSMUST00000083078 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Gm24650-201ENSMUST00000157105 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Gm25978-201ENSMUST00000158698 90 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Sult1c2-ps2-201ENSMUST00000196414 276 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Gm44308-201ENSMUST00000197080 99 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RabggtaQ9JHK4 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RabggtaQ9JHK4 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RabggtaQ9JHK4 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RabggtaQ9JHK4 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RabggtaQ9JHK4 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RabggtaQ9JHK4 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RabggtaQ9JHK4 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RabggtaQ9JHK4 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RabggtaQ9JHK4 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
RabggtaQ9JHK4 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RabggtaQ9JHK4 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RabggtaQ9JHK4 mt-Tv-201ENSMUST00000082389 69 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RabggtaQ9JHK4 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RabggtaQ9JHK4 Gm26421-201ENSMUST00000104279 132 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RabggtaQ9JHK4 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RabggtaQ9JHK4 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RabggtaQ9JHK4 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RabggtaQ9JHK4 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RabggtaQ9JHK4 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RabggtaQ9JHK4 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RabggtaQ9JHK4 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RabggtaQ9JHK4 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
RabggtaQ9JHK4 Gm22772-201ENSMUST00000104451 121 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RabggtaQ9JHK4 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RabggtaQ9JHK4 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RabggtaQ9JHK4 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RabggtaQ9JHK4 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RabggtaQ9JHK4 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RabggtaQ9JHK4 Mir7-1-201ENSMUST00000083500 108 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RabggtaQ9JHK4 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RabggtaQ9JHK4 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RabggtaQ9JHK4 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RabggtaQ9JHK4 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Traj61-201ENSMUST00000165025 72 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Gm25680-201ENSMUST00000116917 126 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Gm22635-201ENSMUST00000116962 126 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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