Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 AC166341.8-201ENSMUST00000221267 108 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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Chmp3Q9CQ10 Gm23601-201ENSMUST00000157259 131 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Gm22454-201ENSMUST00000082583 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Gm22354-201ENSMUST00000083919 70 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Mir802-201ENSMUST00000103258 97 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
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Chmp3Q9CQ10 Gm14947-201ENSMUST00000133704 303 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Gm22827-201ENSMUST00000083766 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Snord80-201ENSMUST00000083801 81 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Gm25681-201ENSMUST00000083938 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Chmp3Q9CQ10 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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Chmp3Q9CQ10 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Chmp3Q9CQ10 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Chmp3Q9CQ10 Gm23065-201ENSMUST00000158236 130 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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Chmp3Q9CQ10 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Chmp3Q9CQ10 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Chmp3Q9CQ10 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Chmp3Q9CQ10 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Chmp3Q9CQ10 Gm26109-201ENSMUST00000083970 70 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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Chmp3Q9CQ10 Gm22503-201ENSMUST00000158983 115 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Chmp3Q9CQ10 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Chmp3Q9CQ10 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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Chmp3Q9CQ10 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Chmp3Q9CQ10 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Chmp3Q9CQ10 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Chmp3Q9CQ10 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Chmp3Q9CQ10 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
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Chmp3Q9CQ10 Gm23349-201ENSMUST00000158432 98 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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Chmp3Q9CQ10 AC140930.2-201ENSMUST00000221803 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Chmp3Q9CQ10 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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Chmp3Q9CQ10 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Chmp3Q9CQ10 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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Chmp3Q9CQ10 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Chmp3Q9CQ10 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Chmp3Q9CQ10 Gm26369-201ENSMUST00000157825 100 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Chmp3Q9CQ10 Gm25633-201ENSMUST00000178565 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Chmp3Q9CQ10 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Chmp3Q9CQ10 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Chmp3Q9CQ10 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Chmp3Q9CQ10 Gm22805-201ENSMUST00000082739 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Chmp3Q9CQ10 Gm24697-201ENSMUST00000083881 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Chmp3Q9CQ10 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Chmp3Q9CQ10 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Chmp3Q9CQ10 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Chmp3Q9CQ10 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Chmp3Q9CQ10 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Chmp3Q9CQ10 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Chmp3Q9CQ10 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Chmp3Q9CQ10 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Chmp3Q9CQ10 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Chmp3Q9CQ10 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Chmp3Q9CQ10 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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