Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gm23244-201ENSMUST00000083375 92 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ddb2Q99J79 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ddb2Q99J79 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ddb2Q99J79 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ddb2Q99J79 Gm24650-201ENSMUST00000157105 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ddb2Q99J79 Gm24649-201ENSMUST00000157106 134 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ddb2Q99J79 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ddb2Q99J79 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ddb2Q99J79 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Gm37778-201ENSMUST00000191732 190 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Olfr921-203ENSMUST00000217114 4120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Gm25329-201ENSMUST00000158041 126 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Gm22429-201ENSMUST00000158553 130 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Olfr921-202ENSMUST00000213958 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Gm23601-201ENSMUST00000157259 131 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Gm25680-201ENSMUST00000116917 126 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Gm22635-201ENSMUST00000116962 126 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Gm25887-201ENSMUST00000157777 84 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Gm44734-201ENSMUST00000206025 237 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Ddb2Q99J79 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 Gm22319-201ENSMUST00000157147 122 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 Zfp813-ps-201ENSMUST00000186652 2506 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 Mir21c-201ENSMUST00000184910 78 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 Gm22212-201ENSMUST00000158096 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 Gm23384-201ENSMUST00000158593 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 Gm44932-201ENSMUST00000206799 121 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 Gm16265-201ENSMUST00000134558 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 Gm22089-201ENSMUST00000158336 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 Gm43977-201ENSMUST00000203970 189 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ddb2Q99J79 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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